250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0277 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  88.28 
 
 
478 aa  830    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2733  transmembrane NADP transhydrogenase subunit beta oxidoreductase protein  76.75 
 
 
486 aa  691    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01840  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  83.86 
 
 
477 aa  742    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0883663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4433  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  88.08 
 
 
478 aa  820    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  89 
 
 
484 aa  842    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2368  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  89.21 
 
 
484 aa  843    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6058  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.32 
 
 
489 aa  703    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6083  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.3 
 
 
490 aa  690    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.07 
 
 
488 aa  731    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6409  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.91 
 
 
491 aa  708    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2826  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.21 
 
 
491 aa  704    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0309139  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.07 
 
 
488 aa  731    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.16 
 
 
489 aa  734    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0669  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.7 
 
 
484 aa  708    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.903362  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3392  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  75.83 
 
 
607 aa  718    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  90.59 
 
 
477 aa  834    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0171  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  88.08 
 
 
478 aa  828    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3788  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.49 
 
 
484 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1144  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.24 
 
 
484 aa  722    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0338  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.57 
 
 
474 aa  674    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4544  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  81.8 
 
 
474 aa  705    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  73.76 
 
 
484 aa  707    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3571  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.2 
 
 
473 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2548  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  76.59 
 
 
490 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  88.28 
 
 
478 aa  830    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0218  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.7 
 
 
484 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  100 
 
 
478 aa  951    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3300  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  81.38 
 
 
474 aa  701    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.95 
 
 
483 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.75 
 
 
486 aa  726    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  76.95 
 
 
486 aa  743    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  99.37 
 
 
478 aa  947    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4261  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.72 
 
 
487 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2682  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.67 
 
 
484 aa  698    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0702  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.7 
 
 
484 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.086333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0393  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  80.38 
 
 
475 aa  714    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  88.66 
 
 
476 aa  830    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0693  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.59 
 
 
484 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0425  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  80.96 
 
 
474 aa  738    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6042  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  80.21 
 
 
475 aa  707    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3798  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  80.96 
 
 
474 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3951  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  81.17 
 
 
474 aa  701    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.372135  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0282  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4750  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  80.21 
 
 
477 aa  688    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  68.49 
 
 
455 aa  592  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  68.28 
 
 
455 aa  591  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1153  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  69.1 
 
 
459 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.54 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.62 
 
 
465 aa  531  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.13 
 
 
467 aa  528  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.16 
 
 
464 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  58.87 
 
 
465 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.46 
 
 
472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60 
 
 
466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.03 
 
 
470 aa  512  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.26 
 
 
464 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.24 
 
 
466 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.92 
 
 
465 aa  508  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.86 
 
 
464 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.54 
 
 
466 aa  508  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.46 
 
 
466 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.53 
 
 
466 aa  505  9.999999999999999e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  58.7 
 
 
465 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.46 
 
 
466 aa  507  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1386  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.09 
 
 
466 aa  503  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1437  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.17 
 
 
467 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1950  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.42 
 
 
468 aa  504  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0105538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.65 
 
 
466 aa  503  1e-141  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0207  NAD(P) transhydrogenase beta subunit  60.08 
 
 
465 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  57.44 
 
 
470 aa  500  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.75 
 
 
493 aa  501  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2798  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.37 
 
 
465 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.85456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.45 
 
 
466 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.21 
 
 
468 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258275 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.21 
 
 
467 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3142  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.87 
 
 
465 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583336  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  54.15 
 
 
471 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  53.99 
 
 
465 aa  486  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.65 
 
 
472 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.35 
 
 
465 aa  483  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0937  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  53.78 
 
 
465 aa  484  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  52.89 
 
 
470 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1181  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.09 
 
 
472 aa  479  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  52.58 
 
 
469 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3253  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  55.6 
 
 
467 aa  473  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.71 
 
 
481 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.07 
 
 
466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.2 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.77 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.77 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.77 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.77 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  52.15 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.77 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  51.77 
 
 
462 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>