250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0393 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3300  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  87.37 
 
 
474 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01840  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.88 
 
 
477 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0883663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  79.33 
 
 
478 aa  723    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.57 
 
 
486 aa  728    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2733  transmembrane NADP transhydrogenase subunit beta oxidoreductase protein  76.95 
 
 
486 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2682  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.32 
 
 
484 aa  665    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  78.51 
 
 
484 aa  722    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2368  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  78.72 
 
 
484 aa  723    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2548  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6058  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  78.31 
 
 
489 aa  692    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6083  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.3 
 
 
490 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.48 
 
 
488 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6409  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.88 
 
 
491 aa  682    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2826  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.39 
 
 
491 aa  685    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0309139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0693  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.79 
 
 
484 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.48 
 
 
488 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  77.37 
 
 
489 aa  712    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  79.87 
 
 
476 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3392  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  76.03 
 
 
607 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  80 
 
 
477 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3788  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.41 
 
 
484 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3571  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  85.5 
 
 
473 aa  739    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4261  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  75.61 
 
 
487 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4433  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  78.5 
 
 
478 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  80.38 
 
 
478 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.62 
 
 
484 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  74.12 
 
 
483 aa  679    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.03 
 
 
484 aa  680    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4544  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  88.87 
 
 
474 aa  781    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.03 
 
 
484 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  76.03 
 
 
484 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0669  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.52 
 
 
484 aa  676    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.903362  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1144  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128305  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  77 
 
 
490 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0218  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  73.52 
 
 
484 aa  674    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496712  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0338  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  83.79 
 
 
474 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0171  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  79.12 
 
 
478 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.670062 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6042  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  97.47 
 
 
475 aa  873    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02470  pyridine nucleotide transhydrogenase, beta subunit  80.17 
 
 
478 aa  711    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  79.33 
 
 
478 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  77.57 
 
 
486 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0702  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  73.52 
 
 
484 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.086333  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0425  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  90.97 
 
 
474 aa  826    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0393  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 
475 aa  942    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3798  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  86.13 
 
 
474 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.998384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3951  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  87.37 
 
 
474 aa  759    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.372135  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0282  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  75.83 
 
 
484 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4750  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  84.94 
 
 
477 aa  741    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  66.31 
 
 
455 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  66.31 
 
 
455 aa  588  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1153  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  66.95 
 
 
459 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.08 
 
 
465 aa  531  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.84 
 
 
466 aa  521  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.83 
 
 
467 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.2 
 
 
464 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.96 
 
 
464 aa  520  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.42 
 
 
465 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  59.54 
 
 
465 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.53 
 
 
464 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  58.25 
 
 
472 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.92 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0207  NAD(P) transhydrogenase beta subunit  60.55 
 
 
465 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.92 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  60.38 
 
 
465 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.69 
 
 
470 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2798  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.04 
 
 
465 aa  501  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.85456 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.78 
 
 
466 aa  500  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.46 
 
 
468 aa  501  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  56.78 
 
 
466 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  61.84 
 
 
466 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.59 
 
 
493 aa  500  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.54 
 
 
466 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  56.87 
 
 
470 aa  495  1e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1437  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  58.87 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  60.08 
 
 
466 aa  490  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1386  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.29 
 
 
466 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3142  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  62.82 
 
 
465 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583336  normal  0.0129428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.08 
 
 
472 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1950  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.42 
 
 
468 aa  481  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0105538 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.2 
 
 
472 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  60.29 
 
 
467 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3253  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  56.37 
 
 
467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1181  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.15 
 
 
472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2884  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  59.75 
 
 
466 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0937  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  53.49 
 
 
465 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  53.7 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1417  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.71 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.857148  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.48 
 
 
466 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.79 
 
 
465 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.13 
 
 
470 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.01 
 
 
471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.05 
 
 
466 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.62 
 
 
464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.62 
 
 
464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2549  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  57.11 
 
 
467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.859449  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.62 
 
 
464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  50.31 
 
 
469 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.58 
 
 
481 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.46 
 
 
471 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>