More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0857 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0857  CBS  100 
 
 		 149 aa  303  6e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.20755e-23  unclonable  0.0000000599831 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1563  hypothetical protein  59.59 
 
 		 151 aa  186  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  60.27 
 
 		 151 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  59.59 
 
 		 151 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  58.33 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  56.55 
 
 		 157 aa  174  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  55.86 
 
 		 153 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  55.86 
 
 		 153 aa  173  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1254  CBS  55.17 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  54.86 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  54.48 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1379  CBS domain-containing protein  53.69 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.925152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  53.69 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  53.79 
 
 		 165 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  55.03 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2616  CBS domain-containing protein  54.42 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0759  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0525231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0870  CBS domain containing protein  52.35 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.258061  normal  0.509671 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3779  XRE family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 146 aa  165  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  53.38 
 
 		 151 aa  165  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1478  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4205  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1679  CBS domain containing protein  54.48 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0978  CBS domain-containing protein  52.35 
 
 		 151 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1657  XRE family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2047  CBS domain containing protein  53.1 
 
 		 151 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.106122  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  52.78 
 
 		 155 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2996  XRE family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 150 aa  159  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4959  CBS domain-containing protein  50.35 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1489  CBS  42.95 
 
 		 239 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1844  hypothetical protein  42.66 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  37.06 
 
 		 143 aa  94.4  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  36.69 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3268  CBS domain-containing protein  35.07 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  30.99 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.58 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  34.69 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  34.01 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  33.56 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  33.56 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  33.56 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  34.04 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  30.56 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.89 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.45 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  30.28 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  30.66 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0774  putative signal transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  35.07 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  33.1 
 
 		 142 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3897  CBS domain containing protein  31.21 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.28 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  32.62 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  30.22 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.26 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 143 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  31.29 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  32.58 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  28.06 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  33.8 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  32.06 
 
 		 146 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0859  XRE family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  28.89 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  32.31 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.39 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  31.91 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.57 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  29.5 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  32.61 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  33.8 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  33.57 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  33.1 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  30.22 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  31.21 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  29.93 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  26.89 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  30.71 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  30.5 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  32.86 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>