More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0631 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  100 
 
 
142 aa  287  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  38.03 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  37.41 
 
 
141 aa  103  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  42.5 
 
 
143 aa  102  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  37.5 
 
 
146 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
145 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
145 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.21 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  35.92 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  31.69 
 
 
142 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  34.51 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  48.57 
 
 
145 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  35.97 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.8 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  35.92 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  32.81 
 
 
145 aa  94.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 
140 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  34.03 
 
 
146 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  34.13 
 
 
148 aa  92  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  34.09 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  34.51 
 
 
144 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.21 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  40.18 
 
 
286 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  35.77 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  34.51 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  38.35 
 
 
156 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  33.57 
 
 
145 aa  90.5  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  30.99 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  32.12 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  32.86 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  37.29 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  32.17 
 
 
146 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  32.86 
 
 
153 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  34.31 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  32.12 
 
 
153 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  32.12 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  38.14 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  32.12 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.62 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1107  signal-transduction protein  36.36 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  41.46 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  34.13 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  34.27 
 
 
143 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  33.58 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  32.87 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1523  signal-transduction protein  34.31 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  31.39 
 
 
153 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2360  CBS  36.11 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00610469  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  43.12 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.83 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  29.79 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  33.33 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  36.84 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  32.85 
 
 
146 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  36.44 
 
 
160 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  39.67 
 
 
142 aa  84.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  41.35 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  29.86 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  34.56 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  32.87 
 
 
146 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  32.12 
 
 
154 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  29.93 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  31.16 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  38.68 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  40.4 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1580  signal-transduction protein  36.8 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0967784 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1254  CBS  29.63 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3078  CBS domain containing protein  34.07 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  32.12 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  34.06 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  30.07 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  29.2 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  43.62 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2114  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  31.43 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1436  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0759  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0525231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4603  XRE family transcriptional regulator  32.85 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.545277  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0976  XRE family transcriptional regulator  32.85 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1478  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.4205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1458  XRE family transcriptional regulator  32.85 
 
 
151 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.867241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2616  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 
154 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1791  XRE family transcriptional regulator  32.85 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1339  XRE family transcriptional regulator  32.85 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>