More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2774 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 321 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  89.69 
 
 		 321 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  88.89 
 
 		 307 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  75.16 
 
 		 315 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  72.1 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  59.49 
 
 		 323 aa  350  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  55.14 
 
 		 323 aa  332  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  56.33 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  56.95 
 
 		 331 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  53.48 
 
 		 334 aa  315  8e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  55.19 
 
 		 338 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  51.07 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  53.89 
 
 		 341 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  56.76 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  53.33 
 
 		 333 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  54.75 
 
 		 340 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  54.75 
 
 		 340 aa  308  8e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  54.55 
 
 		 366 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  48.93 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  57.37 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  51.68 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  54.26 
 
 		 338 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 336 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  50.94 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  52.66 
 
 		 325 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  52.98 
 
 		 331 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  50.93 
 
 		 322 aa  297  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  49.06 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  52.43 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.94 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.94 
 
 		 359 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  54.49 
 
 		 340 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 334 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  52.17 
 
 		 329 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  52.35 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 354 aa  288  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.53 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  50.61 
 
 		 326 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  48.9 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  52.68 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 322 aa  281  9e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  51.88 
 
 		 333 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  49.38 
 
 		 320 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  49.52 
 
 		 321 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  49.69 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  52.04 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  49.68 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  47.38 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 339 aa  275  7e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  45.14 
 
 		 315 aa  275  7e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  47.53 
 
 		 324 aa  275  9e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  48.77 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  48.62 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  48.92 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  48.92 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  48.62 
 
 		 324 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  52.17 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  48.62 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  48.62 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  45.37 
 
 		 323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  48 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.85 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  48.6 
 
 		 323 aa  265  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.38 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.38 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  44.75 
 
 		 323 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  47.5 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  44.86 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.77 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.69 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  43.56 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  48.77 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  46.27 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  48.28 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  46.46 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  49.54 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  48.28 
 
 		 327 aa  258  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  45.17 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  45.17 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.86 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  47.99 
 
 		 344 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 328 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  48.59 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  46.35 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  46.08 
 
 		 330 aa  255  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  46.03 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  46.03 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>