More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0334 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 353 aa  687    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  62.24 
 
 		 340 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  54.55 
 
 		 329 aa  342  5.999999999999999e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  55.93 
 
 		 320 aa  332  6e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  57.27 
 
 		 323 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  58.86 
 
 		 366 aa  328  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  53.94 
 
 		 322 aa  328  6e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  51.62 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  49.43 
 
 		 336 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 		 336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  51.06 
 
 		 325 aa  318  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  54.58 
 
 		 331 aa  318  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  53.62 
 
 		 341 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  49.85 
 
 		 337 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  53.82 
 
 		 315 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  48.94 
 
 		 337 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  55.18 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  54.1 
 
 		 338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  52.25 
 
 		 338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  55.31 
 
 		 321 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  56.9 
 
 		 307 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  54.57 
 
 		 340 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  52.71 
 
 		 321 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  52.61 
 
 		 334 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  51.53 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  54.1 
 
 		 338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.49 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  55.67 
 
 		 331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  54.98 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  53.74 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  50.45 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  50.6 
 
 		 333 aa  292  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 323 aa  292  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.71 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.71 
 
 		 359 aa  285  7e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  50.51 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  50.34 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  48.66 
 
 		 322 aa  281  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  52.38 
 
 		 339 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48.96 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  48.94 
 
 		 329 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  50.85 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  50.85 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  51.01 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.62 
 
 		 357 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.62 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 		 345 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.62 
 
 		 342 aa  276  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  52.22 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  50.85 
 
 		 324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  50.51 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  51.18 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  50.51 
 
 		 324 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  51.17 
 
 		 327 aa  272  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  49.83 
 
 		 324 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  52.15 
 
 		 326 aa  272  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  46.92 
 
 		 354 aa  271  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  52.9 
 
 		 339 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  49 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  45.95 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  49.84 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 		 335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  52.22 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.17 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  49.49 
 
 		 324 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.34 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  50.84 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  52.86 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  52.86 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  50.94 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  48.18 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  52.19 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.32 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  46.76 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  46.76 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  41.29 
 
 		 319 aa  266  5.999999999999999e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  47.12 
 
 		 319 aa  265  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 328 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  47.81 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  46.83 
 
 		 338 aa  265  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  47.81 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  45.76 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.46 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  45.08 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  46.6 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  46.76 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  44.44 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  46.43 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  51.53 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.02 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  47.55 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.08 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>