More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2580 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 339 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  51.44 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  54.58 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  51.95 
 
 		 323 aa  300  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  50.64 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  51.56 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  48.77 
 
 		 329 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  51.12 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 		 341 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  50.86 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 		 338 aa  288  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  49.83 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  50.68 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  52.38 
 
 		 353 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  49.68 
 
 		 321 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  49.68 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  49.51 
 
 		 307 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 340 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  49.35 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  46.3 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  50.51 
 
 		 329 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 		 325 aa  268  8e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  45.6 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  46.01 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  42.94 
 
 		 336 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  45.25 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  44.41 
 
 		 337 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 		 336 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  44.89 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.24 
 
 		 359 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.24 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  49.03 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  45.24 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  45.6 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  46.26 
 
 		 354 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  45.08 
 
 		 321 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  44.09 
 
 		 337 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  44.65 
 
 		 321 aa  259  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  42.68 
 
 		 315 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  46.08 
 
 		 344 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  45.68 
 
 		 339 aa  256  5e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  46.84 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  44.62 
 
 		 326 aa  255  9e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  44.51 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  44.41 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.94 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  47.15 
 
 		 333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  47.6 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  47.64 
 
 		 331 aa  252  6e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  45.99 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  44.51 
 
 		 322 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  45.45 
 
 		 322 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 		 340 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  43.27 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  45.86 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  43.83 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  45.25 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  44.62 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  44.16 
 
 		 315 aa  250  2e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  44.59 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  44.3 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  43.83 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  45 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  44.69 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  44.94 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.22 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  46.98 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  44.94 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  44.94 
 
 		 333 aa  247  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  45.96 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  42.99 
 
 		 321 aa  245  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  42.77 
 
 		 332 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  47.26 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  43.69 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  48 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  44.38 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  47.78 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  45.96 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  52.33 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  47.78 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  47.15 
 
 		 327 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  44.27 
 
 		 331 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  42.19 
 
 		 324 aa  243  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45 
 
 		 328 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.06 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  44.3 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.06 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  44.48 
 
 		 326 aa  242  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.06 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  43.41 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  43.41 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.81 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>