More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1252 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 338 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  90.24 
 
 		 338 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  61.86 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  58.1 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  55.82 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  59.87 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  56.83 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  55.08 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  58.41 
 
 		 325 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  58.31 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  56.88 
 
 		 325 aa  362  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  58.01 
 
 		 331 aa  359  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  53.89 
 
 		 330 aa  354  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  57.76 
 
 		 323 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  56.83 
 
 		 333 aa  349  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  56.51 
 
 		 334 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  55.84 
 
 		 341 aa  345  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  56.01 
 
 		 331 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  56.51 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  54.6 
 
 		 340 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  56 
 
 		 331 aa  335  9e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  54.6 
 
 		 340 aa  334  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  54.43 
 
 		 331 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  52.81 
 
 		 359 aa  332  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  52.81 
 
 		 333 aa  331  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  56.51 
 
 		 329 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  52.05 
 
 		 322 aa  325  5e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  55.03 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  58.56 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  57.73 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  54.6 
 
 		 315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  53.18 
 
 		 323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  51.88 
 
 		 354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  53.16 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  49.84 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  51.89 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  49.36 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.38 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  48.78 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  52.68 
 
 		 321 aa  291  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  51.76 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 321 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  49.21 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  50.63 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.44 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  50.63 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  43.99 
 
 		 319 aa  280  3e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  48.17 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 324 aa  280  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  49.54 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  47.66 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  47.66 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  46.01 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  46.01 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  49.24 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 363 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 357 aa  272  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  48.74 
 
 		 324 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 342 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  47.48 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  48.11 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  50.48 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  52.08 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.99 
 
 		 345 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  47.57 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.99 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  48.43 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.99 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.99 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.22 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.99 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  47.8 
 
 		 345 aa  268  7e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.42 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  47.8 
 
 		 345 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  50.84 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.65 
 
 		 328 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  47.94 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.32 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  45.4 
 
 		 315 aa  267  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  52.58 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.18 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  52.58 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  49.37 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  52.26 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>