More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0413 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  91.74 
 
 		 327 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  89.91 
 
 		 327 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  77.68 
 
 		 327 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  76.76 
 
 		 327 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  70.34 
 
 		 327 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  69.72 
 
 		 327 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  70.03 
 
 		 327 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  69.11 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  69.11 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  69.11 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  69.11 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  69.42 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  69.11 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  69.42 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  69.11 
 
 		 327 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  69.11 
 
 		 327 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  69.42 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  69.11 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  69.42 
 
 		 327 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  69.11 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  68.2 
 
 		 327 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  66.67 
 
 		 346 aa  418  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  65.12 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  65.94 
 
 		 333 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  61.3 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  63.78 
 
 		 330 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  60.18 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  60.92 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  63.66 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  61.88 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3418  KpsF/GutQ  62.54 
 
 		 332 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000032508  normal  0.585789 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  58.82 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  62.58 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  57.72 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  60.74 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  62.5 
 
 		 341 aa  371  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  58.36 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  58.02 
 
 		 330 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  60.37 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  58.02 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  61.92 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  56.21 
 
 		 323 aa  367  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  57.96 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  57.01 
 
 		 324 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  58.77 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  58.77 
 
 		 333 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  59.38 
 
 		 339 aa  362  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  56.36 
 
 		 335 aa  358  6e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  56.31 
 
 		 345 aa  358  9e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  58.33 
 
 		 325 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  56.13 
 
 		 330 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  56.31 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  56.37 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  55.41 
 
 		 324 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  56.05 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  56.65 
 
 		 326 aa  355  5e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  55.41 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  55.73 
 
 		 324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  55.73 
 
 		 324 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  60.14 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  60.14 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  56.05 
 
 		 326 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  56.05 
 
 		 324 aa  348  9e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  56.65 
 
 		 330 aa  345  7e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  52.72 
 
 		 325 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  53.18 
 
 		 326 aa  342  5e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  54.14 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  52.17 
 
 		 324 aa  338  7e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  52.34 
 
 		 324 aa  338  8e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  52.06 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  53.8 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  51.39 
 
 		 325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  52.55 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  51.08 
 
 		 325 aa  335  9e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  54.14 
 
 		 323 aa  335  9e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  51.11 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 324 aa  333  3e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  51.76 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  51.76 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  51.76 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  51.76 
 
 		 325 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  52.55 
 
 		 325 aa  332  8e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  52.22 
 
 		 323 aa  331  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 		 325 aa  330  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  52.41 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 		 325 aa  328  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 		 325 aa  328  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.82 
 
 		 328 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  53.67 
 
 		 321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  51.27 
 
 		 323 aa  326  3e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.5 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.5 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.5 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  49.68 
 
 		 320 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  49.68 
 
 		 320 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.5 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 325 aa  324  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>