More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3307 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
331 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  87.61 
 
 
331 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  68.44 
 
 
333 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  68.44 
 
 
359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  68.44 
 
 
354 aa  424  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  65.26 
 
 
331 aa  416  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  60.42 
 
 
330 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  63.26 
 
 
331 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  58.36 
 
 
329 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  55.94 
 
 
337 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  56.88 
 
 
336 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  56.56 
 
 
336 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  57.63 
 
 
325 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  56.7 
 
 
325 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  57.54 
 
 
341 aa  359  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  55.97 
 
 
337 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  58.1 
 
 
340 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  58.1 
 
 
340 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  57.59 
 
 
338 aa  349  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  56.01 
 
 
338 aa  347  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  56.01 
 
 
338 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  54.52 
 
 
333 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  56.23 
 
 
366 aa  332  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  51.86 
 
 
334 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  51.55 
 
 
333 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  53.99 
 
 
341 aa  328  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  54.95 
 
 
323 aa  325  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  57.39 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  49.23 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  54.98 
 
 
353 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  55.52 
 
 
323 aa  302  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 
315 aa  298  7e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  48.61 
 
 
324 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  49.38 
 
 
320 aa  293  3e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  51.56 
 
 
321 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  47.99 
 
 
324 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  48.61 
 
 
324 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  48.3 
 
 
324 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.96 
 
 
328 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  52.08 
 
 
307 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  49.06 
 
 
344 aa  285  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  47.68 
 
 
324 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  46.89 
 
 
326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  47.99 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  48.02 
 
 
326 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  47.53 
 
 
321 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  47.84 
 
 
321 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  48.75 
 
 
324 aa  281  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  47.06 
 
 
345 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.09 
 
 
320 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.09 
 
 
320 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  46.75 
 
 
345 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  47.37 
 
 
324 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  46.56 
 
 
323 aa  280  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.35 
 
 
324 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
329 aa  280  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  48.42 
 
 
339 aa  278  9e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  44.94 
 
 
324 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  44.79 
 
 
324 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  48.43 
 
 
326 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  48.11 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  45.82 
 
 
334 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48 
 
 
322 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  48 
 
 
322 aa  273  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  46.44 
 
 
320 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  51.37 
 
 
325 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.71 
 
 
342 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.71 
 
 
328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.71 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  47.92 
 
 
325 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  44.94 
 
 
325 aa  268  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  51.2 
 
 
341 aa  268  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.77 
 
 
328 aa  268  8.999999999999999e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  44.75 
 
 
333 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  45.37 
 
 
321 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 
363 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  43.83 
 
 
325 aa  266  5e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.28 
 
 
328 aa  266  5e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  44.76 
 
 
325 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  44.95 
 
 
333 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  42.94 
 
 
330 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  44.95 
 
 
327 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  42.94 
 
 
330 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  44.44 
 
 
325 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 
328 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.77 
 
 
328 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  44.44 
 
 
325 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.77 
 
 
328 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.77 
 
 
328 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.77 
 
 
328 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  45.77 
 
 
328 aa  262  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.77 
 
 
328 aa  262  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.77 
 
 
328 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  44.34 
 
 
327 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.77 
 
 
328 aa  262  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>