More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1670 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 340 aa  654    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  62.37 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  55.79 
 
 		 329 aa  349  5e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  58.06 
 
 		 323 aa  338  7e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  53 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  58.44 
 
 		 366 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  57.5 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  53.55 
 
 		 325 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  57.05 
 
 		 338 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  53.67 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  57.29 
 
 		 331 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  53.87 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  54.69 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  53.04 
 
 		 336 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  53.04 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  52.96 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  55.87 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  58.2 
 
 		 338 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  53.12 
 
 		 331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  56.27 
 
 		 338 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  54.49 
 
 		 321 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  54.32 
 
 		 321 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  53.98 
 
 		 341 aa  306  3e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  55.95 
 
 		 340 aa  305  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  55.03 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  55.95 
 
 		 340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  52.98 
 
 		 333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  52.06 
 
 		 334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  51.43 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  50.59 
 
 		 341 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  54.17 
 
 		 307 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  52.87 
 
 		 331 aa  291  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.8 
 
 		 333 aa  288  6e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.8 
 
 		 359 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.26 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  48.35 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  49.69 
 
 		 320 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  47.15 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  47 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  48.73 
 
 		 321 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  49.22 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  51.09 
 
 		 329 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  49.22 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  52.9 
 
 		 321 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 		 339 aa  278  7e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48.9 
 
 		 322 aa  278  8e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  49.12 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  49.24 
 
 		 354 aa  277  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  47.77 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  48.49 
 
 		 335 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  47.77 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.77 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  49.06 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.09 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 345 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.87 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.87 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  45.11 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.87 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  44.48 
 
 		 332 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.45 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.82 
 
 		 363 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  49.37 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 330 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  44.59 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  46.73 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  48.1 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 342 aa  269  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 328 aa  269  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.16 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  49.06 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  44.79 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.45 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  51.26 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  47.17 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  39.81 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  47.17 
 
 		 345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  47.59 
 
 		 340 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 326 aa  266  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.82 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  48.92 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>