More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0822 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 332 aa  673    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  74.92 
 
 		 330 aa  501  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  74.92 
 
 		 330 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  50.47 
 
 		 320 aa  342  4e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  50.47 
 
 		 320 aa  342  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  53.03 
 
 		 344 aa  341  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  53.42 
 
 		 329 aa  339  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  53.73 
 
 		 324 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  52.01 
 
 		 325 aa  335  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 321 aa  332  6e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  50.93 
 
 		 325 aa  331  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  52.16 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  51.24 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  51.24 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  51.23 
 
 		 324 aa  329  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  52.66 
 
 		 345 aa  328  5.0000000000000004e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 325 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  52.66 
 
 		 345 aa  328  7e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  49.54 
 
 		 325 aa  328  8e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  49.69 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  52.34 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  49.85 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  52.34 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  52.43 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  53.29 
 
 		 324 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.14 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.14 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.14 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.69 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.14 
 
 		 328 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  52.02 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.53 
 
 		 357 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  52.96 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.53 
 
 		 328 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  52.8 
 
 		 325 aa  325  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.53 
 
 		 342 aa  325  7e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  52.96 
 
 		 326 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.82 
 
 		 328 aa  325  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.07 
 
 		 325 aa  325  9e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  50.47 
 
 		 339 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  49.23 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  50.77 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  52.66 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  52.02 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  52.35 
 
 		 324 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  49.85 
 
 		 330 aa  322  7e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.07 
 
 		 345 aa  322  7e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.43 
 
 		 328 aa  321  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  53.07 
 
 		 323 aa  320  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  49.85 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  50.46 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  52.23 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  52.23 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.4 
 
 		 328 aa  320  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.23 
 
 		 328 aa  319  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  53.07 
 
 		 323 aa  319  5e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  49.69 
 
 		 324 aa  318  6e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  51.24 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  49.06 
 
 		 323 aa  318  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.1 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  49.4 
 
 		 326 aa  315  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.15 
 
 		 328 aa  315  7e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.24 
 
 		 363 aa  315  7e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 326 aa  315  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  50.96 
 
 		 320 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  51.23 
 
 		 326 aa  310  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  49.25 
 
 		 333 aa  309  2.9999999999999997e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  50.62 
 
 		 321 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  51.99 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.93 
 
 		 321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  49.22 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  51.43 
 
 		 318 aa  305  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  48.47 
 
 		 341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  48.92 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  47.87 
 
 		 330 aa  302  5.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  48.61 
 
 		 322 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  48.45 
 
 		 321 aa  301  9e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  48.94 
 
 		 333 aa  301  9e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.24 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  45.77 
 
 		 340 aa  297  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.24 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.24 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.24 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  51.24 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.24 
 
 		 327 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  47.83 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  51.24 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  48.91 
 
 		 335 aa  295  6e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  47.26 
 
 		 333 aa  294  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>