More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3174 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  100 
 
 		 323 aa  654    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  62.42 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  61.44 
 
 		 324 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  61.44 
 
 		 324 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  60.56 
 
 		 324 aa  408  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  60.88 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  62.23 
 
 		 329 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  59.87 
 
 		 324 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  60.82 
 
 		 324 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  60.56 
 
 		 324 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  60.87 
 
 		 326 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  59.25 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  58.62 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  55.42 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  58.2 
 
 		 333 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  57.1 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  57.89 
 
 		 345 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  57.89 
 
 		 345 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  56.25 
 
 		 328 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  56.77 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  55.59 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  57.86 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  55.9 
 
 		 323 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  54.66 
 
 		 323 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  55.17 
 
 		 321 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  54.69 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  54.69 
 
 		 320 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  55.35 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  55.17 
 
 		 324 aa  368  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  58.18 
 
 		 341 aa  362  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  54.63 
 
 		 325 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.37 
 
 		 345 aa  358  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 363 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  52.17 
 
 		 324 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  53.11 
 
 		 326 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.06 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.69 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.37 
 
 		 328 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  53.67 
 
 		 325 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.06 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.37 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.1 
 
 		 342 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  53.35 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  53.35 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.1 
 
 		 328 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  54.1 
 
 		 357 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  53.04 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  53.04 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  53.04 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  54.31 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  53.04 
 
 		 325 aa  352  5e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  52.72 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  53.35 
 
 		 325 aa  351  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  55.73 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  54.14 
 
 		 325 aa  349  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  54.6 
 
 		 325 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  57.23 
 
 		 335 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  51.41 
 
 		 325 aa  348  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  55.1 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  56.37 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  52.87 
 
 		 325 aa  345  6e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  52.87 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  55.41 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  53.67 
 
 		 325 aa  342  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  53.29 
 
 		 321 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  54.26 
 
 		 333 aa  341  8e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  55.73 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  51.4 
 
 		 330 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  55.16 
 
 		 325 aa  339  4e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  54.4 
 
 		 330 aa  339  5e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  52.68 
 
 		 333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  53 
 
 		 333 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  52.98 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  52.55 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  51.1 
 
 		 321 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  51.56 
 
 		 320 aa  335  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  52.23 
 
 		 327 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  53.7 
 
 		 322 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  50.46 
 
 		 323 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  52.68 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  51.4 
 
 		 330 aa  332  5e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  51.91 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  53.31 
 
 		 333 aa  329  4e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  53 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  53.31 
 
 		 333 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  54.05 
 
 		 346 aa  328  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  54.37 
 
 		 327 aa  328  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>