More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03660 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  93.19 
 
 		 323 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  78.7 
 
 		 326 aa  523  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  70.37 
 
 		 324 aa  460  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  66.46 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  64.89 
 
 		 328 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  64.31 
 
 		 325 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  65.2 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  64.31 
 
 		 325 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  64.47 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  62.38 
 
 		 321 aa  418  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  63.95 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  64.47 
 
 		 328 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  63.95 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  64.26 
 
 		 363 aa  418  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  64 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  63.69 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  64.47 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  64 
 
 		 325 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  63.95 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  63.64 
 
 		 328 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  63.64 
 
 		 328 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  63.95 
 
 		 328 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  63.64 
 
 		 328 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  62.15 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  62.77 
 
 		 325 aa  411  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  62.46 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  62.77 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  63.32 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  62.15 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  62.15 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  62.15 
 
 		 325 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  65.54 
 
 		 325 aa  411  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  62.38 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  62.38 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  62.38 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  62.7 
 
 		 328 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  62.38 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  62.38 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  62.38 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  62.38 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  62.38 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  63.32 
 
 		 325 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  60.92 
 
 		 325 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  60.19 
 
 		 324 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  60.8 
 
 		 324 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  60.19 
 
 		 324 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  59.88 
 
 		 324 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  58.95 
 
 		 324 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  59.26 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  60.5 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  59.26 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  59.43 
 
 		 339 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  59.26 
 
 		 324 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  61.18 
 
 		 323 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  60.25 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  57.1 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  57.41 
 
 		 326 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  59.05 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  58.07 
 
 		 326 aa  378  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  55.49 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  55.49 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  56.48 
 
 		 324 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  55.28 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  58.49 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  57.59 
 
 		 333 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  57.28 
 
 		 333 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  58.1 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  56.65 
 
 		 325 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  57.46 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  57.59 
 
 		 345 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  57.59 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  54.18 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  54.01 
 
 		 324 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  57.56 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  58.86 
 
 		 328 aa  352  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  54.29 
 
 		 321 aa  345  4e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  54.43 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  56.05 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  54.92 
 
 		 321 aa  342  5e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  55.38 
 
 		 327 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  53.68 
 
 		 330 aa  342  7e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  53.65 
 
 		 321 aa  338  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  55.7 
 
 		 346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  55.38 
 
 		 327 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  54.46 
 
 		 330 aa  335  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  53.48 
 
 		 322 aa  335  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  55.06 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  54.43 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  53.48 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  55.06 
 
 		 327 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  53.16 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.7 
 
 		 327 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  52.22 
 
 		 333 aa  331  9e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  53.16 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>