More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0322 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 340 aa  677    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  64.09 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3213  KpsF/GutQ family protein  62.27 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  62.23 
 
 		 331 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  59.58 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  52.5 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  50.8 
 
 		 321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  51.45 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  45.54 
 
 		 315 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  51.76 
 
 		 339 aa  299  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  50.96 
 
 		 322 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  45.77 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.8 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  50.64 
 
 		 322 aa  295  9e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  48.05 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  51.59 
 
 		 325 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  49.2 
 
 		 333 aa  291  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  49.51 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  44.79 
 
 		 330 aa  290  3e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  51.69 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  48.9 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  48.9 
 
 		 324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  48.55 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  45.73 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  44.16 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  50.96 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  50.16 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  48.74 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  49.19 
 
 		 324 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  49.19 
 
 		 324 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  49.19 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  48.53 
 
 		 324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  47.27 
 
 		 327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  48.11 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  47.9 
 
 		 333 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  46.69 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  42.27 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  50.49 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  45.83 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.63 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  47.02 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 323 aa  279  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  50.79 
 
 		 325 aa  278  6e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  49.36 
 
 		 327 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.76 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  43.85 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  47.84 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 323 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  45.06 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  46.48 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  45.96 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  50.32 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.96 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  45.95 
 
 		 346 aa  276  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  44.44 
 
 		 323 aa  276  5e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  44.09 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  50 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  43.44 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  45.45 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.17 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.68 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  45.81 
 
 		 326 aa  273  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.68 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  50.62 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.68 
 
 		 328 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  49.04 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  49.04 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  47.9 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.17 
 
 		 324 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  44.48 
 
 		 326 aa  272  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 340 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  49.36 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  49.35 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  43.59 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  48.17 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 		 338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  46.11 
 
 		 328 aa  270  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.11 
 
 		 328 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.11 
 
 		 328 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  46.13 
 
 		 333 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.11 
 
 		 328 aa  270  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>