More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0436 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 326 aa  660    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  76.03 
 
 		 328 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  74.85 
 
 		 326 aa  491  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  73.98 
 
 		 326 aa  487  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  75.4 
 
 		 326 aa  487  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  67.79 
 
 		 326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  67.31 
 
 		 323 aa  435  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  48.87 
 
 		 323 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  47.02 
 
 		 326 aa  311  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.4 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  46.33 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  46.33 
 
 		 345 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.06 
 
 		 324 aa  305  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.73 
 
 		 321 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  46.33 
 
 		 333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  46.77 
 
 		 327 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  47.91 
 
 		 335 aa  302  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  47.1 
 
 		 333 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  45.83 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  48.23 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.16 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.16 
 
 		 320 aa  299  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  45.71 
 
 		 326 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 327 aa  298  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 		 322 aa  297  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  49.2 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  49.2 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  48.55 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  47.08 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  45.45 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  46.01 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  47.92 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  45 
 
 		 321 aa  295  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  44.41 
 
 		 324 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  46.84 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  46.25 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  46.75 
 
 		 341 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  47 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  44.1 
 
 		 324 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  43.89 
 
 		 323 aa  293  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  45.68 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  45.75 
 
 		 344 aa  292  6e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  47.62 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  43.75 
 
 		 323 aa  292  6e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  45.4 
 
 		 322 aa  291  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  44.2 
 
 		 321 aa  291  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  46.11 
 
 		 322 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.62 
 
 		 330 aa  291  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  44.59 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  45.14 
 
 		 333 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  43.79 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  46.73 
 
 		 357 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  45.75 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  47.15 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  44.83 
 
 		 320 aa  288  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  47.34 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  45.42 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.1 
 
 		 324 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  48.87 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  48.22 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  46.6 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  46.62 
 
 		 346 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  44.03 
 
 		 324 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  45.79 
 
 		 324 aa  285  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  43.79 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  45.06 
 
 		 330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  47.91 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  47.91 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  43.85 
 
 		 333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  43.44 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  44.44 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  47.91 
 
 		 327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  45.94 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.23 
 
 		 327 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 		 333 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  43.79 
 
 		 323 aa  282  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  43.93 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  47.59 
 
 		 327 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 		 333 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  45.69 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  42.95 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  43.79 
 
 		 323 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  45.77 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  45.14 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  41.3 
 
 		 324 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  47.27 
 
 		 327 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  44.69 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  42.37 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  47.27 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  42.39 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>