More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1665 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
320 aa  646    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  70.25 
 
 
321 aa  460  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  61.83 
 
 
321 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  60.44 
 
 
321 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  60.82 
 
 
322 aa  391  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  58.95 
 
 
324 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  56.39 
 
 
324 aa  362  6e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  56.37 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 
326 aa  301  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  46.25 
 
 
333 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  44.86 
 
 
328 aa  291  8e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  47.99 
 
 
324 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  44.79 
 
 
326 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  44.83 
 
 
326 aa  288  6e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  46.89 
 
 
324 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 
327 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  46.86 
 
 
320 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  46.86 
 
 
320 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  46.27 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  46.58 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  45.2 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  47.96 
 
 
321 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  46.75 
 
 
329 aa  279  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.71 
 
 
321 aa  277  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  44.59 
 
 
326 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  43.65 
 
 
318 aa  276  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  44.34 
 
 
331 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  43.75 
 
 
339 aa  275  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  45.62 
 
 
324 aa  275  6e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  43.32 
 
 
315 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  43.32 
 
 
315 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  45.34 
 
 
324 aa  275  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  45.65 
 
 
324 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  44.41 
 
 
324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  47.02 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  43.65 
 
 
315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  44.09 
 
 
326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  46.98 
 
 
320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 
346 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  46.47 
 
 
319 aa  273  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  45.45 
 
 
324 aa  273  3e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  40.99 
 
 
333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  45 
 
 
327 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  45.62 
 
 
320 aa  272  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  44.2 
 
 
335 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  45.45 
 
 
310 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  43.45 
 
 
326 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  46.08 
 
 
326 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  44.2 
 
 
330 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  45.45 
 
 
324 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  46.88 
 
 
326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  45.45 
 
 
321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  41.12 
 
 
357 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  41.8 
 
 
333 aa  268  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  43.96 
 
 
324 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  43.65 
 
 
339 aa  267  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.77 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.13 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.77 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  44.73 
 
 
323 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  43.95 
 
 
325 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.77 
 
 
357 aa  266  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  45 
 
 
332 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  45.62 
 
 
327 aa  265  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  46.25 
 
 
322 aa  265  7e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  45.22 
 
 
326 aa  265  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  44.82 
 
 
321 aa  265  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  42.95 
 
 
323 aa  264  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  43.34 
 
 
333 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  44.73 
 
 
323 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  43.34 
 
 
333 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  47.28 
 
 
335 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  43.35 
 
 
326 aa  263  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  43.75 
 
 
330 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  46.25 
 
 
327 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.77 
 
 
345 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 
327 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.9 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.77 
 
 
363 aa  262  6e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  43.83 
 
 
310 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  43.96 
 
 
323 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  46.25 
 
 
327 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  41.67 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  43.17 
 
 
333 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  44.79 
 
 
344 aa  261  8e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  45.94 
 
 
322 aa  261  8.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  43.75 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  42.68 
 
 
333 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  42.36 
 
 
333 aa  260  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  41.36 
 
 
330 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.17 
 
 
328 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  43.81 
 
 
339 aa  259  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  42.17 
 
 
319 aa  260  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  45 
 
 
341 aa  259  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 
327 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  45.31 
 
 
327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  45.77 
 
 
322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  43.91 
 
 
329 aa  259  6e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>