More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1778 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  100 
 
 
315 aa  634    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  95.87 
 
 
315 aa  613  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  95.24 
 
 
315 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  78.1 
 
 
318 aa  519  1e-146  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  57.64 
 
 
311 aa  368  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  54.02 
 
 
310 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1393  KpsF/GutQ family protein  53.38 
 
 
310 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  52.6 
 
 
342 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  49.68 
 
 
321 aa  316  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7389  KpsF/GutQ  49.19 
 
 
310 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1806  KpsF/GutQ family protein  52.73 
 
 
317 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.172857 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1362  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.49 
 
 
333 aa  309  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  49.67 
 
 
329 aa  305  8.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5735  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.06 
 
 
320 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5916  KpsF/GutQ family protein  49.83 
 
 
310 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0826034  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  51.28 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  51.44 
 
 
321 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  50.16 
 
 
320 aa  300  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  50.63 
 
 
320 aa  297  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3262  arabinose-5-phosphate isomerase  48.53 
 
 
351 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3211  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.53 
 
 
311 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3249  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.53 
 
 
311 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.212815  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  50.34 
 
 
333 aa  295  5e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  49.2 
 
 
321 aa  295  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  49.67 
 
 
330 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  48.52 
 
 
335 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  45.75 
 
 
333 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6257  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 
311 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  46.62 
 
 
333 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  48.56 
 
 
319 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 
326 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  52.76 
 
 
321 aa  293  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  45.25 
 
 
320 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  45.25 
 
 
320 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  49.52 
 
 
320 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  46.84 
 
 
319 aa  290  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  46.28 
 
 
339 aa  290  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5957  KpsF/GutQ family protein  45.81 
 
 
334 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  51.13 
 
 
326 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  51.83 
 
 
321 aa  289  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  48.89 
 
 
332 aa  289  4e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 
319 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  47.94 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  49.04 
 
 
322 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  49.36 
 
 
322 aa  288  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 
321 aa  288  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
315 aa  288  9e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  48.32 
 
 
330 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  49.03 
 
 
330 aa  287  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6185  KpsF/GutQ family protein  50.72 
 
 
291 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
345 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47.78 
 
 
326 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 
345 aa  286  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  48.87 
 
 
323 aa  285  7e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  49.51 
 
 
323 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  47.77 
 
 
331 aa  285  8e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  48.88 
 
 
321 aa  285  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  47.06 
 
 
333 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  45.98 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  47.92 
 
 
324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  50.17 
 
 
323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  47.6 
 
 
324 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  46.58 
 
 
326 aa  281  9e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  46.3 
 
 
333 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  50.82 
 
 
329 aa  280  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.62 
 
 
345 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1810  KpsF/GutQ  48.88 
 
 
326 aa  280  3e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220338  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  46.3 
 
 
339 aa  279  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3219  polysialic acid capsule expression protein KpsF  46.73 
 
 
339 aa  279  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  46.3 
 
 
333 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  46.73 
 
 
339 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  46.73 
 
 
339 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  48.08 
 
 
324 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.1 
 
 
357 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.62 
 
 
363 aa  278  9e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  46.33 
 
 
333 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  48.52 
 
 
330 aa  277  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.1 
 
 
342 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.1 
 
 
328 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  46.75 
 
 
328 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  47.59 
 
 
326 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  49.5 
 
 
329 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 
322 aa  276  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  44.98 
 
 
323 aa  275  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  43.65 
 
 
320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  45.51 
 
 
327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  47.76 
 
 
344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  45.19 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.73 
 
 
328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  46.33 
 
 
327 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  49.51 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  45.13 
 
 
328 aa  273  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.13 
 
 
328 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.13 
 
 
328 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.45 
 
 
328 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.13 
 
 
328 aa  273  3e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  45.13 
 
 
328 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.13 
 
 
328 aa  273  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>