More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0467 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  100 
 
 
328 aa  670    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  76.03 
 
 
326 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  71.92 
 
 
326 aa  484  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  71.52 
 
 
326 aa  481  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  71.07 
 
 
326 aa  481  1e-134  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  65.5 
 
 
326 aa  441  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  66.35 
 
 
323 aa  433  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  49.36 
 
 
326 aa  315  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  47.13 
 
 
320 aa  312  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  48.46 
 
 
339 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  46.58 
 
 
324 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 
327 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.3 
 
 
333 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.45 
 
 
321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  47.77 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  46.47 
 
 
323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  48.71 
 
 
335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  50.48 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  46.82 
 
 
321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 
327 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 
330 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  47.25 
 
 
327 aa  306  3e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  43.95 
 
 
320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  43.95 
 
 
320 aa  305  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  47.45 
 
 
321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
346 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  47.63 
 
 
333 aa  305  8.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47.44 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  47.9 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  46.28 
 
 
327 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.96 
 
 
324 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  49.52 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  49.52 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 
327 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  46.27 
 
 
324 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  44.9 
 
 
321 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
333 aa  299  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  50.64 
 
 
341 aa  298  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  45.34 
 
 
324 aa  297  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  46.47 
 
 
323 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  45.65 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  47.53 
 
 
330 aa  296  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  45.65 
 
 
324 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
330 aa  296  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  45.22 
 
 
321 aa  296  4e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  48.23 
 
 
327 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  48.23 
 
 
327 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  47.19 
 
 
324 aa  295  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  46.96 
 
 
345 aa  295  6e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  48.22 
 
 
332 aa  295  7e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  45.62 
 
 
322 aa  295  7e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
345 aa  295  7e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  47.39 
 
 
326 aa  295  8e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  48.23 
 
 
327 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  45.34 
 
 
324 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  45.34 
 
 
324 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  46.04 
 
 
325 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  44.9 
 
 
324 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  44.9 
 
 
324 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  49.21 
 
 
330 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  48.69 
 
 
329 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.96 
 
 
328 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.91 
 
 
327 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  47.06 
 
 
324 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.65 
 
 
328 aa  291  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  44.86 
 
 
320 aa  291  8e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  44.59 
 
 
324 aa  291  8e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  47.06 
 
 
333 aa  291  9e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.01 
 
 
328 aa  291  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.65 
 
 
328 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0529  KpsF/GutQ family protein  48.23 
 
 
327 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64598  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  46.47 
 
 
344 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.65 
 
 
328 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.65 
 
 
328 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  47.59 
 
 
327 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  45.86 
 
 
321 aa  290  2e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 
333 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  46.5 
 
 
322 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  49.04 
 
 
328 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  46.96 
 
 
321 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  45.4 
 
 
322 aa  290  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  45.4 
 
 
322 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  45.83 
 
 
323 aa  289  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.69 
 
 
357 aa  289  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.69 
 
 
328 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  47.27 
 
 
327 aa  288  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  45.6 
 
 
323 aa  288  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.69 
 
 
342 aa  288  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  45.22 
 
 
325 aa  288  9e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  48.54 
 
 
327 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.33 
 
 
328 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  44.58 
 
 
357 aa  287  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.69 
 
 
328 aa  287  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.69 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.69 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.69 
 
 
328 aa  287  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>