More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0404 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 323 aa  656    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  68.65 
 
 		 326 aa  464  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  69.18 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  68.97 
 
 		 326 aa  454  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  66.15 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  66.35 
 
 		 328 aa  434  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  62.73 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 		 321 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  48.9 
 
 		 321 aa  319  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  49.53 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 		 321 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47.8 
 
 		 326 aa  311  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  46.75 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  47.81 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.9 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  47.81 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.06 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  48.58 
 
 		 335 aa  305  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  48.44 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  48.11 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  45.51 
 
 		 344 aa  299  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  47.95 
 
 		 330 aa  299  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  46.13 
 
 		 324 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  46.06 
 
 		 323 aa  298  8e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  45.43 
 
 		 333 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  46.44 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  47.12 
 
 		 339 aa  296  4e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4201  KpsF/GutQ family protein  50.63 
 
 		 333 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.899261  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  45.2 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  46.44 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.84 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.84 
 
 		 320 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  45.2 
 
 		 324 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  45.51 
 
 		 324 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  46.44 
 
 		 324 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  47.78 
 
 		 330 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  44.58 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  44.79 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  44.79 
 
 		 345 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  45.82 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  45.85 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  45.05 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  44.89 
 
 		 324 aa  290  3e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  44.89 
 
 		 324 aa  289  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  44.58 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  44.89 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  45.71 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  45.17 
 
 		 357 aa  286  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3809  arabinose-5-phosphate isomerase  50.51 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  47.47 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  45.17 
 
 		 323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 339 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  46.84 
 
 		 333 aa  285  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  46.33 
 
 		 325 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  45.54 
 
 		 326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  46.11 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  46.73 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  47.32 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  42.72 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  47 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  46.13 
 
 		 321 aa  281  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  45.57 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 345 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  45.34 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  44.76 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  46.18 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  45.31 
 
 		 333 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  44.76 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  45.83 
 
 		 330 aa  279  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  47.43 
 
 		 338 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 		 328 aa  279  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  46.18 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  45.37 
 
 		 325 aa  278  6e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.81 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 357 aa  278  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  47.17 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  44.63 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  45.77 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  43.45 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.49 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.49 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.49 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.49 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.95 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  43.52 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  42.19 
 
 		 330 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.17 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.51 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  41.18 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  44.3 
 
 		 325 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>