More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0166 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
319 aa  636    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  53.8 
 
 
315 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  50.48 
 
 
320 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  50.48 
 
 
320 aa  328  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.62 
 
 
321 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  49.04 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  49.36 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  49.36 
 
 
324 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  49.04 
 
 
324 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  48.41 
 
 
323 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 
324 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  48.9 
 
 
326 aa  316  3e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  49.21 
 
 
324 aa  316  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 
329 aa  316  3e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  48.75 
 
 
321 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  47.45 
 
 
344 aa  314  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.1 
 
 
328 aa  311  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  48.42 
 
 
341 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.1 
 
 
357 aa  312  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.1 
 
 
342 aa  311  7.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  49.04 
 
 
326 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  48.25 
 
 
323 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  48.73 
 
 
324 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  47.42 
 
 
324 aa  309  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  48.75 
 
 
321 aa  309  5e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.39 
 
 
333 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  47.57 
 
 
324 aa  308  9e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.08 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  45.05 
 
 
333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  47.77 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  51.18 
 
 
322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  49.06 
 
 
321 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  48.69 
 
 
324 aa  306  3e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  47.3 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  47.45 
 
 
340 aa  305  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  48.68 
 
 
333 aa  305  9.000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  47.78 
 
 
336 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  49.51 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  47.98 
 
 
321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  48.09 
 
 
324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  46.52 
 
 
326 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  48.58 
 
 
325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  47.45 
 
 
340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  44.73 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  44.76 
 
 
326 aa  302  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  47.98 
 
 
322 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  48.58 
 
 
325 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.37 
 
 
327 aa  301  9e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 
337 aa  301  9e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  47.98 
 
 
322 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.14 
 
 
345 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.45 
 
 
363 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  48.14 
 
 
345 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  47.32 
 
 
325 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  51.02 
 
 
325 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  47.32 
 
 
325 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.13 
 
 
328 aa  299  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  47.48 
 
 
325 aa  298  6e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  47 
 
 
325 aa  298  7e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.81 
 
 
345 aa  298  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  47.32 
 
 
325 aa  298  8e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  47.15 
 
 
336 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  46.86 
 
 
325 aa  298  9e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  46.88 
 
 
325 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  46.88 
 
 
325 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  46.88 
 
 
325 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  46.88 
 
 
325 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  48.4 
 
 
325 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  45.94 
 
 
325 aa  296  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  46.84 
 
 
337 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  47.45 
 
 
323 aa  295  8e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.81 
 
 
328 aa  295  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  46.69 
 
 
325 aa  292  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  44.59 
 
 
323 aa  292  5e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  45.43 
 
 
320 aa  291  7e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  46.69 
 
 
325 aa  291  9e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  44.37 
 
 
333 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.48 
 
 
328 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  46.65 
 
 
333 aa  288  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  43.41 
 
 
333 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0359  KpsF/GutQ  46.33 
 
 
327 aa  288  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  45.57 
 
 
325 aa  288  9e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  48.97 
 
 
325 aa  287  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.16 
 
 
328 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.16 
 
 
328 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  43.81 
 
 
326 aa  287  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.16 
 
 
328 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.84 
 
 
328 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  45.63 
 
 
333 aa  286  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>