More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1943 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  100 
 
 		 320 aa  635    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  68.97 
 
 		 321 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  69.28 
 
 		 321 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  68.34 
 
 		 321 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  66.14 
 
 		 321 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  64.06 
 
 		 322 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  64.06 
 
 		 322 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  67.71 
 
 		 322 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  55.45 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  55.45 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  57.73 
 
 		 326 aa  358  7e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  58.18 
 
 		 329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  55.31 
 
 		 324 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  55.17 
 
 		 326 aa  353  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  55.31 
 
 		 324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  56.19 
 
 		 339 aa  351  1e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  55 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  54.69 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  54.69 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  55.62 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  54.37 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  54.06 
 
 		 324 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  56.88 
 
 		 335 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  54.69 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  53.44 
 
 		 324 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  59.81 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  52.98 
 
 		 344 aa  338  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  52.7 
 
 		 324 aa  336  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  52.87 
 
 		 324 aa  336  3.9999999999999995e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  51.56 
 
 		 323 aa  335  3.9999999999999995e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  54.75 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  52.81 
 
 		 330 aa  330  2e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  53.8 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  51.75 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.97 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  52.04 
 
 		 323 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  56.87 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  53.61 
 
 		 323 aa  329  4e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.65 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  52.5 
 
 		 330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  52.53 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.7 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2638  KpsF/GutQ family protein  55.62 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.545154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  51.88 
 
 		 345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3030  sugar isomerase, KpsF/GutQ family  55.62 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  51.88 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.7 
 
 		 342 aa  326  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  54.52 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  51.43 
 
 		 325 aa  326  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  50.79 
 
 		 325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.7 
 
 		 328 aa  325  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  51.75 
 
 		 325 aa  325  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.02 
 
 		 328 aa  325  5e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  51.9 
 
 		 323 aa  325  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  51.11 
 
 		 325 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  53.31 
 
 		 333 aa  324  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  55.06 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  51.9 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.02 
 
 		 345 aa  323  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  52.22 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.38 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0720  KpsF/GutQ family protein  51.11 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.500239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  51.43 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  54.75 
 
 		 327 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  51.43 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  51.43 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  51.43 
 
 		 325 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  54.31 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.02 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.02 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.02 
 
 		 328 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.02 
 
 		 328 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0538  capsule expression protein KpsF/GutQ  56.96 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  53.02 
 
 		 328 aa  322  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  50.63 
 
 		 321 aa  322  8e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  48.75 
 
 		 315 aa  321  9.000000000000001e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  52.38 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  51.42 
 
 		 333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  50.63 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  54.31 
 
 		 330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  54.75 
 
 		 327 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  54.23 
 
 		 333 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  50.63 
 
 		 323 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  47.02 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  55.06 
 
 		 327 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>