More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1114 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  100 
 
 
320 aa  645    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1886  arabinose 5-phosphate isomerase  77.19 
 
 
317 aa  501  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.106886  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  74.12 
 
 
319 aa  475  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1810  KpsF/GutQ  71.97 
 
 
326 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.220338  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0064  KpsF/GutQ family protein  63.75 
 
 
321 aa  414  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  60.06 
 
 
320 aa  392  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  50.32 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.68 
 
 
321 aa  301  9e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1617  arabinose-5-phosphate isomerase  51.56 
 
 
315 aa  301  1e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
315 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1437  arabinose-5-phosphate isomerase  51.25 
 
 
315 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.743757  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  46.73 
 
 
321 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
322 aa  299  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  49.53 
 
 
322 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1778  arabinose-5-phosphate isomerase  50.63 
 
 
315 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.458122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  47.32 
 
 
321 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  48.42 
 
 
321 aa  292  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  49.21 
 
 
318 aa  292  6e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  46.15 
 
 
324 aa  287  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  48.05 
 
 
333 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  45.62 
 
 
326 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  46.15 
 
 
324 aa  286  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  46.39 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  48.53 
 
 
333 aa  281  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.69 
 
 
320 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.69 
 
 
320 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  45 
 
 
324 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  48.46 
 
 
319 aa  280  3e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001785  arabinose 5-phosphate isomerase  48.05 
 
 
329 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.54 
 
 
345 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  48.54 
 
 
345 aa  279  5e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  50.17 
 
 
326 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 
324 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  47.74 
 
 
342 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 
324 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  50.48 
 
 
335 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  47.74 
 
 
324 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  44.09 
 
 
340 aa  275  6e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  46.03 
 
 
328 aa  275  9e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  46.3 
 
 
324 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  43.87 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  45.79 
 
 
320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  49.16 
 
 
324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  46.77 
 
 
324 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  45.54 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  45.02 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  44.59 
 
 
324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  45.54 
 
 
323 aa  272  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  43.93 
 
 
339 aa  271  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  44.76 
 
 
330 aa  271  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  48.39 
 
 
327 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  45.48 
 
 
344 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3372  KpsF/GutQ family protein  45.73 
 
 
325 aa  271  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.600625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.51 
 
 
328 aa  270  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.06 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
327 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.06 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  48.39 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  44.19 
 
 
333 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  45.16 
 
 
327 aa  269  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  44.65 
 
 
322 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0822  KpsF/GutQ family protein  46.69 
 
 
332 aa  269  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  44.84 
 
 
330 aa  269  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.22 
 
 
327 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 
327 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.26 
 
 
357 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  46.94 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  44.38 
 
 
329 aa  268  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.26 
 
 
342 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0731  arabinose-5-phosphate isomerase  46.94 
 
 
325 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.26 
 
 
328 aa  268  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  46.45 
 
 
326 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 
327 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 
327 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  46.67 
 
 
319 aa  267  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.3 
 
 
324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  42.95 
 
 
345 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  47.42 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  43.12 
 
 
326 aa  266  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  47.42 
 
 
327 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  47.59 
 
 
330 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  43.49 
 
 
333 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  44.44 
 
 
323 aa  266  5e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  45.16 
 
 
333 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.42 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0503  arabinose 5-phosphate isomerase  43.41 
 
 
324 aa  265  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  45.17 
 
 
329 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4235  KpsF/GutQ family protein  45.73 
 
 
325 aa  265  7e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000366362 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  45.79 
 
 
330 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02814  conserved hypothetical protein  45.61 
 
 
339 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000939788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02764  hypothetical protein  45.61 
 
 
339 aa  265  8.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000908304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.26 
 
 
328 aa  265  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  43.57 
 
 
357 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  41.94 
 
 
331 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  43.44 
 
 
330 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  46.3 
 
 
335 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>