More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3213 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3213  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 331 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0335  KpsF/GutQ family protein  64.42 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00223142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2308  KpsF/GutQ family protein  60.98 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  62.27 
 
 		 340 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2808  KpsF/GutQ family protein  60.99 
 
 		 331 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  47.56 
 
 		 357 aa  305  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  47.28 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  46.75 
 
 		 332 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  45.43 
 
 		 320 aa  282  5.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  46.82 
 
 		 331 aa  282  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  48.9 
 
 		 321 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  48.25 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  47.8 
 
 		 323 aa  277  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 324 aa  277  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  46.37 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  49.21 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  45 
 
 		 324 aa  276  5e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  45.94 
 
 		 326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  46.3 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0617  KpsF/GutQ family protein  44.05 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.851934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  47.17 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.66 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.95 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  42.86 
 
 		 326 aa  271  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  45.34 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  45.31 
 
 		 323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0137  KpsF/GutQ family protein  48.59 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0731  Arabinose-5-phosphate isomerase  48.01 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  46.88 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1907  KpsF/GutQ family protein  44.31 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  48.1 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  44.37 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  43.38 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  43.09 
 
 		 326 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  46.37 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  47.12 
 
 		 335 aa  266  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  48.87 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 		 326 aa  265  8e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  44 
 
 		 326 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.01 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.01 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  47.6 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  45.6 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  49.36 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1612  KpsF/GutQ family protein  44.31 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  46.06 
 
 		 345 aa  263  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  43.67 
 
 		 318 aa  263  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  48.9 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  45.74 
 
 		 345 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  47.4 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  47.4 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  48.47 
 
 		 326 aa  262  6e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0591  KpsF/GutQ family protein  44.24 
 
 		 329 aa  262  6.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000664449  hitchhiker  0.000000000000829793 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.45 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  45.6 
 
 		 322 aa  261  8e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  47.12 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  44.41 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  48.73 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  44.06 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  41.27 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  42.26 
 
 		 321 aa  259  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  46.6 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  43.96 
 
 		 323 aa  259  4e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  47.25 
 
 		 333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1492  KpsF/GutQ family protein  42.06 
 
 		 330 aa  259  7e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  40.19 
 
 		 324 aa  258  9e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1114  arabinose 5-phosphate isomerase  44.55 
 
 		 320 aa  258  9e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  44.97 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  46.65 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  45.74 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  45.74 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3612  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.164557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3674  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.835894  normal  0.0549633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  47.9 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.14 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  44.97 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.38 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.45 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0307  KpsF/GutQ family protein  48.38 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  44.69 
 
 		 324 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1058  KpsF/GutQ family protein  45.79 
 
 		 338 aa  255  6e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.335757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  47.57 
 
 		 339 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  47.13 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0922  sugar isomerase  41.43 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  45.02 
 
 		 310 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  46.47 
 
 		 332 aa  255  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  46.08 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  46.08 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  43.34 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.08 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>