More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0947 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 337 aa  676    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  86.35 
 
 		 336 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  87.24 
 
 		 336 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  80.42 
 
 		 337 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  79.08 
 
 		 325 aa  531  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  79.38 
 
 		 325 aa  527  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  64.69 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  60.19 
 
 		 338 aa  401  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  57.68 
 
 		 330 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  57.32 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  57.14 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  57.46 
 
 		 338 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  60.58 
 
 		 331 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  56.21 
 
 		 341 aa  371  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  55.08 
 
 		 338 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  55.18 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  57.32 
 
 		 354 aa  362  4e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  55.56 
 
 		 340 aa  361  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  54.92 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  55.94 
 
 		 331 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  53.65 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  55.31 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  53.65 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  53.21 
 
 		 341 aa  345  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  54.83 
 
 		 331 aa  341  1e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  53.33 
 
 		 329 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  53.21 
 
 		 323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  51.25 
 
 		 322 aa  325  5e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  52.53 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  53.36 
 
 		 366 aa  316  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  50.61 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  54.3 
 
 		 340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  50.32 
 
 		 353 aa  309  2.9999999999999997e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  51.76 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  50.77 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  50.46 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  48.93 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  52.4 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  50.46 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  48.75 
 
 		 315 aa  301  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 		 319 aa  301  9e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  50 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.92 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  49.69 
 
 		 324 aa  299  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  50.15 
 
 		 324 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  49.54 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.27 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  49.23 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.27 
 
 		 357 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.27 
 
 		 342 aa  295  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  50 
 
 		 344 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  48.31 
 
 		 324 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  50 
 
 		 326 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.36 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.36 
 
 		 345 aa  288  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  47.18 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  47.33 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  48.76 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  48.76 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  47.73 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.38 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  47.49 
 
 		 339 aa  286  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.83 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.66 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  46.44 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.03 
 
 		 363 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.04 
 
 		 328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  45.57 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  45.57 
 
 		 320 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  46.55 
 
 		 333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  46.13 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  46.25 
 
 		 323 aa  281  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  48.11 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  47.19 
 
 		 320 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  45.71 
 
 		 315 aa  278  6e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  51.07 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  50.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  45.48 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  50.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  45.43 
 
 		 323 aa  277  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  45.79 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  50.71 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3507  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  49.53 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  45.48 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  46.2 
 
 		 326 aa  275  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3505  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.13 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  45.86 
 
 		 333 aa  275  8e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  45.94 
 
 		 331 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  51.12 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  49.52 
 
 		 341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  48.3 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  44.89 
 
 		 321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3576  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.82 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>