More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4326 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 		 341 aa  676    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  63.46 
 
 		 338 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  61.86 
 
 		 338 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  54.17 
 
 		 336 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  52.4 
 
 		 336 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  59.66 
 
 		 331 aa  352  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  51.91 
 
 		 329 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  56.09 
 
 		 325 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  53.21 
 
 		 337 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  51.17 
 
 		 337 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  56.23 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  54.68 
 
 		 338 aa  342  5.999999999999999e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  53.7 
 
 		 330 aa  338  9e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  55.36 
 
 		 333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  55.36 
 
 		 334 aa  335  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  54.74 
 
 		 323 aa  329  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  52.41 
 
 		 359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  52.41 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  55.08 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  53.5 
 
 		 341 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  55.99 
 
 		 331 aa  322  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  53.99 
 
 		 333 aa  322  8e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  55.74 
 
 		 366 aa  319  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  53.5 
 
 		 340 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  53.33 
 
 		 322 aa  317  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  53.99 
 
 		 331 aa  316  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  53.38 
 
 		 354 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  53.18 
 
 		 340 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  53.35 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  52.92 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  50.81 
 
 		 329 aa  298  7e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  53.74 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  52.43 
 
 		 321 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  53.95 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  53.74 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  53.92 
 
 		 340 aa  291  8e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  47.65 
 
 		 339 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  49.83 
 
 		 322 aa  278  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  45.81 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  45.95 
 
 		 324 aa  275  8e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  44.03 
 
 		 315 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  51.4 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  47.39 
 
 		 321 aa  270  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  48.67 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  46.58 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  47.56 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0073  KpsF/GutQ family protein  48.93 
 
 		 321 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0675  KpsF/GutQ family protein  49.02 
 
 		 345 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0761  arabinose-5-phosphate isomerase  49.02 
 
 		 345 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3965  KpsF/GutQ family protein  45.03 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  49.35 
 
 		 333 aa  263  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  42.68 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  42.68 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  50.84 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  48.1 
 
 		 324 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  43.38 
 
 		 319 aa  262  4.999999999999999e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  46.73 
 
 		 321 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  45.1 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  47.38 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  48.1 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  47.14 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  47.78 
 
 		 324 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.78 
 
 		 321 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  48.31 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2788  sugar phosphate isomerase  44.51 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000495576  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  48.06 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  47.63 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  47.81 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  47.15 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  45.79 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  47.63 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02232  arabinose 5-phosphate isomerase  47.39 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  47.08 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  47.15 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.74 
 
 		 328 aa  256  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  48.57 
 
 		 325 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  46.09 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  43.45 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.84 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.78 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  44.31 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  46.45 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  48.68 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  47.23 
 
 		 329 aa  252  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  46.67 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.65 
 
 		 357 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  42.81 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.74 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  46.93 
 
 		 327 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  46.67 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  46.67 
 
 		 333 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0756  KpsF/GutQ family protein  48.2 
 
 		 323 aa  250  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  43.93 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  42.37 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  46.37 
 
 		 344 aa  248  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  39.81 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  42.37 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>