More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2737 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2737  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
331 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  63.38 
 
 
333 aa  411  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  63.38 
 
 
359 aa  412  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4269  KpsF/GutQ family protein  63.33 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0335  KpsF/GutQ family sugar isomerase  58.18 
 
 
330 aa  395  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3307  KpsF/GutQ family protein  61.03 
 
 
331 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4539  KpsF/GutQ family protein  60.87 
 
 
336 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  61.76 
 
 
338 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  60.75 
 
 
337 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0864  KpsF/GutQ family protein  60.56 
 
 
336 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0931  sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  60.69 
 
 
325 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3609  KpsF/GutQ family protein  59.82 
 
 
331 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3722  capsule expression protein  61.99 
 
 
331 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0769  KpsF/GutQ family protein  59.19 
 
 
337 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.703235 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3413  KpsF/GutQ family protein  59.19 
 
 
325 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.285872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  59.01 
 
 
341 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1995  KpsF/GutQ family protein  59.37 
 
 
338 aa  371  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0928427  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1252  KpsF/GutQ family protein  58.1 
 
 
338 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3607  KpsF/GutQ family protein  57.96 
 
 
340 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220324  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3899  KpsF/GutQ family protein  57.96 
 
 
340 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10465  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4326  KpsF/GutQ family protein  56.88 
 
 
341 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0192  KpsF/GutQ family protein  54.08 
 
 
334 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1362  arabinose 5-phosphate isomerase  57.01 
 
 
333 aa  359  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.385255  normal  0.0702904 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4997  KpsF/GutQ family protein  54.66 
 
 
333 aa  358  7e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0692534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  54.09 
 
 
329 aa  350  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5015  KpsF/GutQ family protein  55 
 
 
329 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.336764 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2774  KpsF/GutQ family protein  55.35 
 
 
321 aa  338  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2814  KpsF/GutQ family protein  55.62 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0014  KpsF/GutQ  57.91 
 
 
366 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1153  sugar phosphate isomerase  55.91 
 
 
307 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1208  KpsF/GutQ family protein  54.8 
 
 
323 aa  328  7e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.905604 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3588  arabinose-5-phosphate isomerase  54.92 
 
 
320 aa  328  9e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2608  KpsF/GutQ family protein  55.41 
 
 
315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.730254 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1670  KpsF/GutQ family protein  57.34 
 
 
340 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.225758  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0334  KpsF/GutQ family protein  54.58 
 
 
353 aa  319  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.139935  normal  0.203565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2497  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 
322 aa  318  7e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3854  KpsF/GutQ family protein  53.14 
 
 
323 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  51.89 
 
 
326 aa  305  8.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  53.53 
 
 
339 aa  299  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  50.77 
 
 
329 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  50.15 
 
 
321 aa  295  8e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2580  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
339 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.597133  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  50.61 
 
 
330 aa  294  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.69 
 
 
328 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  49.54 
 
 
321 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.07 
 
 
328 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3306  KpsF/GutQ family protein  48.09 
 
 
325 aa  291  8e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.57065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.92 
 
 
321 aa  289  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.07 
 
 
328 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  50.62 
 
 
322 aa  289  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.77 
 
 
345 aa  289  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 
324 aa  288  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  50.31 
 
 
322 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  47.77 
 
 
324 aa  288  1e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  50.16 
 
 
324 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  50.78 
 
 
324 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  49.84 
 
 
324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  48.9 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  49.84 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0279  D-arabinose 5-phosphate isomerase  48.88 
 
 
363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.954706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  49.23 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0691  KpsF/GutQ family protein  48.57 
 
 
325 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.983087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.3 
 
 
328 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0721  KpsF/GutQ family protein  48.57 
 
 
325 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0712  KpsF/GutQ family protein  48.57 
 
 
325 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0114298 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3663  KpsF/GutQ family protein  48.57 
 
 
325 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000627199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  47.76 
 
 
324 aa  286  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3083  arabinose-5-phosphate isomerase  48.25 
 
 
325 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  49.84 
 
 
324 aa  285  5e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.52 
 
 
328 aa  285  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.52 
 
 
357 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  49.52 
 
 
342 aa  285  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  49.53 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03062  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00212199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0510  KpsF/GutQ family protein  46.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3685  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03013  hypothetical protein  46.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0503  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.183909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  49.22 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3493  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3390  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.997652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4519  D-arabinose 5-phosphate isomerase  47.22 
 
 
328 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.498324  normal  0.41247 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3573  D-arabinose 5-phosphate isomerase  46.91 
 
 
328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  50.16 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0166  KpsF/GutQ family protein  46.03 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.62 
 
 
325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0563  KpsF/GutQ family protein  47.96 
 
 
323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.57393  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  48.62 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0959  KpsF/GutQ family protein  48.62 
 
 
333 aa  282  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.444411 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0678  KpsF/GutQ family protein  46.98 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.732488  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3344  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
325 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  51.28 
 
 
341 aa  282  7.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  49.54 
 
 
344 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  45.92 
 
 
334 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  45.89 
 
 
321 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03188  arabinose 5-phosphate isomerase  46.42 
 
 
326 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.655458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  49.22 
 
 
324 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0677  KpsF/GutQ family protein  46.98 
 
 
325 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.953587  normal  0.0677039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0494  KpsF/GutQ family protein  46.67 
 
 
325 aa  280  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0102894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>