More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0171 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  100 
 
 
132 aa  263  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  57.58 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  40.94 
 
 
191 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  33.33 
 
 
230 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  34.71 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  35 
 
 
413 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  35 
 
 
412 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  35 
 
 
413 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0976  CBS  36.36 
 
 
909 aa  73.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000281258  normal  0.107884 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
873 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.54 
 
 
903 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  31.94 
 
 
230 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.13 
 
 
877 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  35.42 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  36.13 
 
 
907 aa  70.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 
243 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.56 
 
 
230 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  34.03 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  30.92 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  33.33 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  31.16 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  36.13 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  30.07 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.61 
 
 
863 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  36.97 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  27.33 
 
 
242 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  30.07 
 
 
229 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  29.8 
 
 
339 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2758  signal-transduction protein  29.75 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
149 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  34.43 
 
 
875 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.73 
 
 
149 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  32.79 
 
 
879 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  35.34 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  29.41 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  32.79 
 
 
879 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.74 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
863 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  29.41 
 
 
125 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.077992 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  32.77 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 
242 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  30.43 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 
231 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  28 
 
 
242 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  30.87 
 
 
339 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  29.69 
 
 
399 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 
246 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 
229 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.33 
 
 
863 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  34.45 
 
 
904 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  30.88 
 
 
226 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  34.53 
 
 
427 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  29.8 
 
 
243 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  27.74 
 
 
243 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.82 
 
 
210 aa  62.8  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  30.14 
 
 
423 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  29.29 
 
 
152 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  32.41 
 
 
428 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  27.05 
 
 
378 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  33.85 
 
 
883 aa  61.6  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.88 
 
 
903 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  31.4 
 
 
880 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  35.83 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  37.01 
 
 
213 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  31.97 
 
 
377 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3792  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.88 
 
 
903 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  25.76 
 
 
261 aa  61.6  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  32.48 
 
 
877 aa  61.6  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  32.21 
 
 
348 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  32.62 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.04 
 
 
867 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  35.43 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.23 
 
 
769 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  34.81 
 
 
141 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 
133 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 
149 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.5 
 
 
873 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  32.5 
 
 
859 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2776  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000774578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1421  polynucleotide adenylyltransferase region  31.93 
 
 
909 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 
885 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  28.93 
 
 
315 aa  59.3  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  41.86 
 
 
280 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  32.18 
 
 
688 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  32.76 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  35.58 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  34 
 
 
234 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3773  putative signal transduction protein with CBS domains  36.21 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0705  putative transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  33.33 
 
 
145 aa  57.8  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  25.35 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  33.07 
 
 
209 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
618 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>