More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0692 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  100 
 
 
636 aa  1326    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  43.94 
 
 
640 aa  593  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0900  CBS domain containing protein  41.05 
 
 
619 aa  482  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.32031  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5287  CBS domain-containing protein  37.63 
 
 
493 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4753  glutamate--cysteine ligase GCS2  39.48 
 
 
493 aa  340  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4774  glutamate--cysteine ligase GCS2  37.25 
 
 
495 aa  337  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292636  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0031  hypothetical protein  39.27 
 
 
492 aa  333  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2290  hypothetical protein  35.35 
 
 
492 aa  327  5e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.134356  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4876  hypothetical protein  34.62 
 
 
492 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4965  hypothetical protein  34.62 
 
 
492 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5244  hypothetical protein  34.62 
 
 
492 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195978  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2969  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.6 
 
 
487 aa  320  6e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.602585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1325  hypothetical protein  36.29 
 
 
496 aa  320  7e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.952669  normal  0.634647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0495  glutamate--cysteine ligase GCS2  35.28 
 
 
497 aa  318  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1357  hypothetical protein  34.29 
 
 
492 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276987  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1230  glutamate--cysteine ligase, GCS2  37.69 
 
 
489 aa  317  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2138  hypothetical protein  35.06 
 
 
492 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0510229 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33930  hypothetical protein  35.28 
 
 
498 aa  311  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0037  hypothetical protein  39.19 
 
 
492 aa  309  9e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5470  hypothetical protein  36.07 
 
 
496 aa  309  9e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246317  normal  0.910371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0942  glutamate--cysteine ligase, GCS2  34.92 
 
 
502 aa  309  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13729  hypothetical protein  33.27 
 
 
509 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.666667 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6393  hypothetical protein  33.27 
 
 
502 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2286  hypothetical protein  33.27 
 
 
481 aa  293  6e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.027042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0560  hypothetical protein  34.83 
 
 
487 aa  293  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2112  hypothetical protein  35.09 
 
 
479 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.963723  normal  0.0569925 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3579  hypothetical protein  34.41 
 
 
502 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1740  hypothetical protein  33.74 
 
 
495 aa  282  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.171739  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1230  hypothetical protein  33.4 
 
 
477 aa  269  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2305  hypothetical protein  33.33 
 
 
478 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146397  normal  0.100958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03720  hypothetical protein  35.65 
 
 
500 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1225  hypothetical protein  33.4 
 
 
477 aa  266  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14920  hypothetical protein  31.74 
 
 
503 aa  265  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0591157  normal  0.1456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6279  glutamate-cysteine ligase, family 2  33.94 
 
 
478 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00546777  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1073  hypothetical protein  33.26 
 
 
491 aa  262  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209756  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1017  glutamate--cysteine ligase, GCS2  32.45 
 
 
476 aa  262  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.22607  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1832  hypothetical protein  33.13 
 
 
477 aa  260  7e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1911  hypothetical protein  32.05 
 
 
494 aa  253  9.000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0196  hypothetical protein  32.05 
 
 
477 aa  246  8e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0710624  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1917  hypothetical protein  22.07 
 
 
513 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1008  hypothetical protein  24.84 
 
 
514 aa  107  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1380  hypothetical protein  25.06 
 
 
571 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.491652 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1897  hypothetical protein  22.42 
 
 
517 aa  105  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0611  hypothetical protein  21.47 
 
 
519 aa  103  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0877  hypothetical protein  26.02 
 
 
519 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  28.68 
 
 
142 aa  73.9  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 
256 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  34.33 
 
 
210 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  34.59 
 
 
140 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  29.32 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
145 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
145 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.33 
 
 
208 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 
219 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 
141 aa  68.9  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
162 aa  68.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
145 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  38.52 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.08 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  29.79 
 
 
142 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  32.56 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  32.58 
 
 
331 aa  66.6  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  34.43 
 
 
166 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 
140 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  28.68 
 
 
142 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  37.39 
 
 
162 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  26.28 
 
 
143 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.2 
 
 
147 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 
145 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  32.31 
 
 
221 aa  64.3  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  31.82 
 
 
220 aa  63.9  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 
143 aa  63.9  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  28.68 
 
 
138 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0656  CBS domain containing protein  34.71 
 
 
142 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  31.97 
 
 
146 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.4 
 
 
148 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  31.97 
 
 
146 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
143 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  31.97 
 
 
146 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 
315 aa  62  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  30 
 
 
605 aa  62.4  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  29.69 
 
 
223 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  31.69 
 
 
242 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 
172 aa  62  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  37.5 
 
 
214 aa  61.2  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
221 aa  61.2  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  27.21 
 
 
154 aa  61.2  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
143 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  31.58 
 
 
153 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
143 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
134 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  30 
 
 
136 aa  60.8  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  31.13 
 
 
152 aa  60.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  31.3 
 
 
149 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
143 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  29.23 
 
 
143 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  37.84 
 
 
154 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
143 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 
143 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>