More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2009 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 143 aa  290  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  91.73 
 
 		 155 aa  258  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  63.36 
 
 		 138 aa  169  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  41.3 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.33 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  32.05 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  32.7 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  35.37 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 		 247 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  33.6 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  34.29 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  30.72 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  34.38 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  29.61 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2679  signal-transduction protein  31.3 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.136192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  33.85 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 		 242 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0774  CBS  30.07 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1901  KpsF/GutQ family protein  33.85 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.1 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.1 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  27.16 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  28.39 
 
 		 390 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  28.15 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  29.55 
 
 		 379 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  33.59 
 
 		 385 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0073  sugar isomerase, KpsF/GutQ  33.07 
 
 		 333 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0068  sugar isomerase, KpsF/GutQ  33.07 
 
 		 359 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.695575  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  34.69 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.45 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  28.79 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.1 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1568  cyclic nucleotide-binding protein  32.81 
 
 		 634 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  28.85 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  30.3 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  35.11 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 385 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  34.26 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1898  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 270 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527597  normal  0.365874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  36.15 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  29.55 
 
 		 586 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  30.6 
 
 		 614 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1569  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 476 aa  57.8  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1407  signal transduction protein  31.16 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  28.76 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1141  signal-transduction protein  34.62 
 
 		 150 aa  57  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  28.39 
 
 		 234 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  28.36 
 
 		 513 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  28.36 
 
 		 513 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  34.11 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.25 
 
 		 147 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  30.41 
 
 		 243 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35.78 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  33.08 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  28.36 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  29.77 
 
 		 606 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.03 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0013  signal transduction protein  31.25 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.636073  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  27.61 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45046  predicted protein  27.64 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.786213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2019  putative signal transduction protein with CBS domains  31.36 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  28.91 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0446  putative signal transduction protein with CBS domains  34.53 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0212406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 391 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  30.47 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  32.09 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  33.64 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  32.74 
 
 		 490 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  29.11 
 
 		 427 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.16 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1225  signal-transduction protein  28.68 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.276884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  30.63 
 
 		 331 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2190  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.27 
 
 		 963 aa  54.7  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  30.22 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  31.01 
 
 		 324 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3033  signal-transduction protein  33.05 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0966775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  31.69 
 
 		 392 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  33.59 
 
 		 341 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.09 
 
 		 508 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  34.85 
 
 		 368 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  32.31 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3956  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  27.91 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.94 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  33.85 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  30 
 
 		 502 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3611  KpsF/GutQ family protein  28.68 
 
 		 325 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0947  KpsF/GutQ family protein  30.77 
 
 		 337 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.04 
 
 		 488 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  28.03 
 
 		 295 aa  53.9  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  34.11 
 
 		 341 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>