More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2082 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  100 
 
 		 125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.077992 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2758  signal-transduction protein  66.67 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  29.41 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  28.12 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  23.61 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  32.52 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  31.71 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  26.67 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  28.48 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  28.21 
 
 		 380 aa  57.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  32.48 
 
 		 605 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  24.37 
 
 		 250 aa  57  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  27.07 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.68 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0672  signal-transduction protein  28.23 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  24.06 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  26.02 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  29.75 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  31.53 
 
 		 688 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.26 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.26 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  29.84 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.26 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  29.17 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  38.55 
 
 		 643 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  31.62 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  26.32 
 
 		 234 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3542  putative signal transduction protein with CBS domains  33.66 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.329551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.17 
 
 		 226 aa  53.5  0.0000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 		 689 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  25.56 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  26.12 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  27.97 
 
 		 339 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  26.89 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  25.2 
 
 		 279 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  26.4 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  28.81 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  27.05 
 
 		 640 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.54 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 385 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  28.33 
 
 		 606 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  23.21 
 
 		 148 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1043  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 624 aa  51.6  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  24.17 
 
 		 279 aa  51.2  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  24.11 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  25.98 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  26.89 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  28.33 
 
 		 606 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  30 
 
 		 332 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  26.19 
 
 		 290 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 688 aa  50.8  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  22.6 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  28.89 
 
 		 201 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31 
 
 		 499 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  36.14 
 
 		 290 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 		 606 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  23.29 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  32 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  27.83 
 
 		 337 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  33.04 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0532  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.392409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  29.86 
 
 		 348 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  29.57 
 
 		 338 aa  50.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  23.57 
 
 		 226 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  26.05 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  28.23 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2679  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.136192 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1229  signal-transduction protein  30.97 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  31.3 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  24.19 
 
 		 636 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  29.51 
 
 		 907 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3238  putative signal transduction protein with CBS domains  32.5 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.365049  normal  0.128899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 		 228 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.17 
 
 		 875 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3763  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  28.1 
 
 		 459 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  31.03 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  24.39 
 
 		 300 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  33.03 
 
 		 688 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  22.7 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.03 
 
 		 520 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  28.91 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  27.42 
 
 		 143 aa  48.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3706  cystathionine beta-synthase  27.27 
 
 		 459 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  24.09 
 
 		 242 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  25.38 
 
 		 291 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  26.23 
 
 		 411 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  27.83 
 
 		 342 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  24.31 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>