281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2758 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2758  signal-transduction protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2082  signal-transduction protein  66.67 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.077992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  29.75 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  35.96 
 
 		 284 aa  58.2  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  27.83 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  28.67 
 
 		 230 aa  57  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0188  signal-transduction protein  31.75 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.885258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  27.89 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  26.53 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  29.55 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.21 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0480  cyclic nucleotide-binding protein  35.62 
 
 		 608 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  37.5 
 
 		 280 aa  53.9  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  30.34 
 
 		 348 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  28.87 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2441  signal-transduction protein  27.97 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.528968  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  27.73 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0672  signal-transduction protein  30.83 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  30.4 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  24.6 
 
 		 282 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  31.15 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 250 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  30.22 
 
 		 332 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.39 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 		 688 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1395  signal-transduction protein  35.79 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0871644 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2430  signal-transduction protein  36 
 
 		 565 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.15974  normal  0.429408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  37.5 
 
 		 282 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  27.27 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  28.1 
 
 		 877 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0663  signal-transduction protein  28.1 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 		 228 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2578  putative signal transduction protein with CBS domains  27.2 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345851  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  24.32 
 
 		 149 aa  50.1  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  26.42 
 
 		 320 aa  50.1  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  31.96 
 
 		 689 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  26.45 
 
 		 413 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  33.68 
 
 		 327 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  31.06 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  27.54 
 
 		 223 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.41 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  26.72 
 
 		 202 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  23.08 
 
 		 217 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  26.03 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  27.5 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  25.38 
 
 		 291 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  32.73 
 
 		 335 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1895  KpsF/GutQ family protein  32.99 
 
 		 338 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0258547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  24.81 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  26.32 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  27.12 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  24.58 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  24.31 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  35.65 
 
 		 688 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  24.06 
 
 		 315 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  31.58 
 
 		 327 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  32.48 
 
 		 287 aa  48.9  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 279 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  27.59 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  31.58 
 
 		 327 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2225  KpsF/GutQ family protein  28.57 
 
 		 341 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  31.58 
 
 		 327 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  26.05 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2230  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.24818  normal  0.0199639 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  24.79 
 
 		 412 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  26.21 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  25 
 
 		 411 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  30.7 
 
 		 333 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  26.06 
 
 		 247 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  31.58 
 
 		 327 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2198  signal-transduction protein  36.7 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0268449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 256 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  25.83 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  28.1 
 
 		 234 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  25.58 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  34.78 
 
 		 688 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  26.4 
 
 		 139 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2358  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.66 
 
 		 494 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.890412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  25.83 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  29.27 
 
 		 333 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.03 
 
 		 875 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.09 
 
 		 877 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  26.06 
 
 		 229 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  23.73 
 
 		 380 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2847  polynucleotide adenylyltransferase region  29.51 
 
 		 874 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4486  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0214678 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.03 
 
 		 605 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  34.48 
 
 		 309 aa  47  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2680  signal-transduction protein  28.85 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0686487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3742  Polynucleotide adenylyltransferase region  30.43 
 
 		 903 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4285  KpsF/GutQ family protein  26.61 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.746781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  26.06 
 
 		 246 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  30.53 
 
 		 327 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>