More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5608 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  100 
 
 		 151 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  51.94 
 
 		 139 aa  151  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  53.91 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  48.12 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  47.1 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  49.61 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  49.24 
 
 		 143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  49.61 
 
 		 133 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  49.24 
 
 		 143 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  48.51 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  48.48 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  48.48 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  48.48 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  49.24 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  48.48 
 
 		 143 aa  133  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  47.29 
 
 		 143 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  48.09 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  49.24 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  48.03 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  47.66 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  47.79 
 
 		 140 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  44.03 
 
 		 181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  42.11 
 
 		 133 aa  117  7e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  33.85 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.09 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  30.88 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  30.88 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  30.88 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  31.75 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  35.97 
 
 		 380 aa  68.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  34.88 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.81 
 
 		 256 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 625 aa  64.3  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.14 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  30.82 
 
 		 210 aa  62  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  34.06 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  27.41 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  33.57 
 
 		 209 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.54 
 
 		 862 aa  62  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.19 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 251 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 		 688 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.92 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  29.77 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.87 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  29.01 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  31.34 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.25 
 
 		 488 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.67 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.5 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  26.87 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 		 615 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  31.13 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  29.08 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  30.99 
 
 		 211 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 689 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0565  signal-transduction protein  30.43 
 
 		 188 aa  57  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  29.69 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  31.25 
 
 		 606 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  31.25 
 
 		 606 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  32.86 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.37 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  22.63 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  28.26 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  31.43 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  31.11 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  29.61 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  29.69 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  27.59 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.38 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  27.59 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  32.56 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  31.06 
 
 		 883 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  24.09 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  30.41 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  30.41 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  29.77 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  29.77 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  28.95 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  25 
 
 		 320 aa  54.7  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  30.41 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  30.41 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  30.41 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  30.41 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  30.41 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>