More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3995 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  271  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  49.61 
 
 
151 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  48.09 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  46.09 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  43.31 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  42.19 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  45.97 
 
 
143 aa  114  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 
142 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 
143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 
143 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  45.16 
 
 
143 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 
143 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 
143 aa  110  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  45.16 
 
 
143 aa  110  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  44.35 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  44.44 
 
 
140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  43.55 
 
 
143 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  42.4 
 
 
152 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  36.72 
 
 
133 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  40.62 
 
 
134 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  41.41 
 
 
134 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  40.77 
 
 
181 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  33.33 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  31.25 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  31.25 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  31.25 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
208 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  30.47 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  30.4 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  31.2 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  29.13 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  29.69 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  31.2 
 
 
380 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.56 
 
 
216 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  29.37 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 
211 aa  64.3  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
279 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  28.8 
 
 
282 aa  62.8  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.2 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  25.95 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  32.81 
 
 
875 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.56 
 
 
256 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  32.59 
 
 
217 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
279 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  28 
 
 
280 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1143  signal-transduction protein  30.6 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.430444 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 
172 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
258 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  36.59 
 
 
214 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  32.81 
 
 
862 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30 
 
 
216 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  30.65 
 
 
132 aa  60.5  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  27.2 
 
 
280 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  29.01 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  30.77 
 
 
492 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 
279 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 
211 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 
431 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 
215 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  29.6 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  23.85 
 
 
141 aa  59.3  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 
385 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 
230 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  28.57 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0364  signal-transduction protein  28.36 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.612757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  33.8 
 
 
229 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  27.41 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  25.19 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  34.51 
 
 
229 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  28.46 
 
 
491 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
845 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
223 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  31.5 
 
 
223 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  31.79 
 
 
154 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  32.82 
 
 
155 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  28.29 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2820  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
642 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  26.56 
 
 
883 aa  57.4  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1762  signal-transduction protein  29.01 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  30.43 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.03 
 
 
688 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>