More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2794 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 142 aa  290  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  73.88 
 
 		 134 aa  216  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  67.42 
 
 		 134 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  60.14 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  60.14 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  60.14 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  60.14 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  59.15 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  63.28 
 
 		 152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  62.22 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  56.52 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  56.52 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  56.52 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  54.93 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  61.48 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  53.91 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  46.92 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  47.29 
 
 		 181 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  46.51 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  37.78 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  39.37 
 
 		 139 aa  114  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  38.58 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  36.64 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  34.11 
 
 		 865 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  30 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.73 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  29.69 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  25.98 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.33 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.33 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.33 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.82 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  36 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  36.79 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.52 
 
 		 158 aa  62  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  26.77 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.92 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.94 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  30.16 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  31.3 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  30.2 
 
 		 426 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  28.15 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  27.91 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1797  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.966854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 313 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  28.36 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  29.37 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  44.62 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.78 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  30.95 
 
 		 877 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.92 
 
 		 138 aa  57  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  30.22 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  29.92 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  28.46 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  26.4 
 
 		 217 aa  57  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 252 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  25 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  34.34 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.24 
 
 		 769 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  31 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  31 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  28.81 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  25.37 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.86 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  25 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  28.57 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.81 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.45 
 
 		 845 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1762  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0911451  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.28 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  30.95 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  28.39 
 
 		 348 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  31.01 
 
 		 615 aa  54.3  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  26.98 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  30.3 
 
 		 313 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  31.54 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  46.3 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  31.54 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  23.62 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  28.68 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  31.13 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  29.14 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  30.53 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 625 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  25.56 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>