More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1843 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  377  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  50.75 
 
 		 149 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  47.29 
 
 		 142 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  49.23 
 
 		 140 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  48.09 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  48.09 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  48.09 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  48.09 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  48.85 
 
 		 140 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  44.27 
 
 		 134 aa  121  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  44.03 
 
 		 151 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  49.24 
 
 		 152 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  46.21 
 
 		 143 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  45.8 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  40.15 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  44.7 
 
 		 136 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  45.19 
 
 		 134 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  43.85 
 
 		 139 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  45.04 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  45.8 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  43.51 
 
 		 143 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  40.77 
 
 		 133 aa  101  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  36.92 
 
 		 143 aa  99.4  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  32.09 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  25 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.35 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.35 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.35 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  29.41 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  31.98 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  34.88 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  38.69 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  31.07 
 
 		 348 aa  60.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  29.92 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  34.85 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  32.84 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  36.72 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  29.92 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  30.95 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  28.87 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  29.48 
 
 		 845 aa  58.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  30.77 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  31.85 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  31.71 
 
 		 491 aa  57.8  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 140 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  31.34 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  31.45 
 
 		 865 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  29.85 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.1 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  28.36 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  27.78 
 
 		 413 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  30.66 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  33.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  33.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  25.58 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  25.58 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  25.58 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  26.43 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  33.57 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  33.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  33.57 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  33.57 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0072  CBS domain containing membrane protein  30.22 
 
 		 398 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  33.57 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  33.57 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  28.47 
 
 		 412 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  33.57 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  27.78 
 
 		 413 aa  55.1  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  26.43 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  33.57 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.55 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 769 aa  55.1  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1594  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.84 
 
 		 489 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  28.29 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  33.33 
 
 		 503 aa  54.7  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  34.19 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  26.43 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  26.56 
 
 		 490 aa  54.3  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.92 
 
 		 488 aa  54.3  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.23 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.34 
 
 		 487 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  26.62 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  27.34 
 
 		 487 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  26.62 
 
 		 487 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  28.36 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>