More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1700 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  100 
 
 		 133 aa  266  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  42.11 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  41.09 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  41.73 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  38.58 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  37.4 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  37.98 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  37.4 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  36.43 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 		 143 aa  100  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  39.69 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  36.43 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  36.64 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  38.58 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  37.69 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  33.09 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  35.07 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  31.34 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 256 aa  70.9  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  28.03 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  32.61 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  29.32 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  29.32 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  29.32 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  28.57 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 625 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.46 
 
 		 883 aa  63.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  31.82 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  31.01 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  30.23 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 216 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  27.01 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  32.09 
 
 		 221 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  29.85 
 
 		 224 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  33.86 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.07 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.52 
 
 		 688 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 		 251 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  28.89 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.71 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  29.46 
 
 		 769 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  29.17 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  29.17 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  26.77 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  32.84 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  31.72 
 
 		 423 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  27.08 
 
 		 152 aa  57  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  26.17 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 688 aa  57.4  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  30.95 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  32.17 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  27.41 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  30.33 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  29.2 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  27.94 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  48.15 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  29.13 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4061  signal-transduction protein  33.07 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  29.1 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  27.48 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  31.54 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  28.36 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  27.56 
 
 		 845 aa  55.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  26.9 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.03 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0521  diguanylate cyclase  28.35 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  34.44 
 
 		 321 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  28.48 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  26.56 
 
 		 262 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  28.8 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  28.35 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  28.57 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.9 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  26.87 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  32.28 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  29.01 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>