246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4877 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  100 
 
 		 141 aa  289  7e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  45.45 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  35.51 
 
 		 140 aa  100  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  34.29 
 
 		 139 aa  99.4  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  33.85 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 		 143 aa  94.7  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  36.72 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 134 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  35.16 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  36.84 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  36.64 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  30 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  33.08 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  28.03 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  25.53 
 
 		 428 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  24.24 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.82 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.82 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  25.33 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  25.55 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  25.76 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  25.76 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 232 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  21.28 
 
 		 427 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  24.03 
 
 		 502 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  26.71 
 
 		 346 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  26.35 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  26.71 
 
 		 382 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  24.24 
 
 		 379 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.61 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 382 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 397 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  26.71 
 
 		 397 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 397 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  24.18 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  23.29 
 
 		 416 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  22.56 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  26.67 
 
 		 491 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  23.19 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  25.17 
 
 		 214 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  22.22 
 
 		 376 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  26.71 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  28.17 
 
 		 465 aa  52  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  22.22 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  21.37 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 279 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.26 
 
 		 313 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  26.92 
 
 		 258 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  24.67 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  25.76 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 		 250 aa  50.8  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  24.26 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  20.29 
 
 		 382 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 216 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  22.9 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  29.23 
 
 		 500 aa  50.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 145 aa  50.1  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1879  CBS  22.82 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  22.86 
 
 		 410 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  21.97 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  22.79 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  24.83 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3527  CBS domain-containing protein  18.44 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.215012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  21.01 
 
 		 382 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0525  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.03 
 
 		 481 aa  49.7  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  24.82 
 
 		 373 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.7 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  23.03 
 
 		 389 aa  49.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  23.03 
 
 		 389 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  19.85 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  19.86 
 
 		 378 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  23.08 
 
 		 219 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  25.38 
 
 		 500 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0597  signal transduction protein  24.81 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  32.26 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  19.85 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  23.62 
 
 		 503 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  23.85 
 
 		 215 aa  48.1  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  19.85 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  28.47 
 
 		 845 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  20.74 
 
 		 368 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  23.85 
 
 		 215 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  24.66 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  21.21 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  34.33 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>