More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0958 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  75.54 
 
 		 139 aa  226  9e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  69.29 
 
 		 141 aa  204  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  69.29 
 
 		 141 aa  204  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  69.29 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  69.29 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  69.29 
 
 		 141 aa  205  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  69.29 
 
 		 141 aa  203  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  68.57 
 
 		 141 aa  203  6e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  68.57 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  68.57 
 
 		 172 aa  202  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  68.84 
 
 		 139 aa  201  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  69.34 
 
 		 142 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  64.29 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  67.15 
 
 		 139 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  32.59 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  35.25 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.33 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  34.53 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  30.94 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  31.88 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  31.88 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  34.04 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  31.88 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  29.5 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.25 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  29.29 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 		 373 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.09 
 
 		 225 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 216 aa  60.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  30.5 
 
 		 153 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  29.93 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  28.79 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  27.86 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  27.86 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  28.46 
 
 		 502 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4458  CBS domain containing membrane protein  31.91 
 
 		 640 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  29.23 
 
 		 490 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  29.55 
 
 		 500 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 		 873 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  30.5 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  28.87 
 
 		 210 aa  57.4  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  27.34 
 
 		 214 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 217 aa  57  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  25.68 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  24.24 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  29.86 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.77 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  28.08 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  25.93 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.15 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  24.43 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  28.68 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  29.86 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.7 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  28.47 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  29.86 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  29.08 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  27.94 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  31.11 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  30.5 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  27.21 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  26.43 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  23.48 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  28.46 
 
 		 378 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  27.21 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  30.3 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  27.07 
 
 		 382 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  24.64 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  28.29 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  27.07 
 
 		 382 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  25.71 
 
 		 215 aa  53.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 211 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  29.1 
 
 		 579 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 149 aa  52.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  27.21 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  27.69 
 
 		 503 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  28.79 
 
 		 490 aa  52.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  22.96 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  26.71 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  27.81 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  26.28 
 
 		 211 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  26.03 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  23.97 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>