More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3522 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 134 aa  274  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  75.19 
 
 		 134 aa  217  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2794  CBS domain-containing protein  67.42 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.349051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  63.43 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  63.43 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  63.43 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  63.43 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1120  CBS domain-containing protein  61.94 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  63.43 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  62.41 
 
 		 143 aa  178  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  64.18 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  61.19 
 
 		 143 aa  176  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  61.19 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2268  signal transduction protein  66.41 
 
 		 152 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.220391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  63.43 
 
 		 136 aa  173  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  48.51 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  47.69 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  45.8 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1843  CBS domain-containing protein  45.19 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  38.76 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  37.8 
 
 		 139 aa  107  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  37.98 
 
 		 133 aa  105  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  41.41 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4877  putative acetoin utilization protein AcuB  38.46 
 
 		 141 aa  92.8  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 865 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  33.08 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  33.83 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  33.83 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  33.83 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  29.01 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.54 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  31.58 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.58 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  33.07 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3944  signal-transduction protein  26.4 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.898238  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 615 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  25.9 
 
 		 279 aa  60.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 		 618 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  30.16 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.47 
 
 		 862 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  29.41 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  26.4 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  27.46 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  37.63 
 
 		 688 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  31.65 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  28.57 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.71 
 
 		 598 aa  58.9  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  34.07 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1660  CBS domain containing protein  27.27 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0113728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1990  CBS domain containing protein  26.52 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  27.91 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 		 380 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 688 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  27.13 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.78 
 
 		 845 aa  57.4  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 		 208 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  33.07 
 
 		 216 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  31.11 
 
 		 313 aa  57  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  30.47 
 
 		 143 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  31.79 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0095  putative signal transduction protein with CBS domains  28.79 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  28.91 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  30.95 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  30.23 
 
 		 615 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  29.93 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.92 
 
 		 605 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  32.81 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  29.77 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  31.01 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  47.17 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  26.36 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  29.23 
 
 		 615 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  36.56 
 
 		 688 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  30.95 
 
 		 877 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  28.77 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  31.58 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.78 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  29.23 
 
 		 615 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 636 aa  55.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  29.23 
 
 		 615 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  32.56 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  32.33 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  32.31 
 
 		 597 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  35.79 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  30 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.25 
 
 		 769 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2351  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000984272  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  27.48 
 
 		 282 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2369  cyclic nucleotide-binding protein  27.48 
 
 		 615 aa  54.3  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>