More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1918 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  299  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  79.72 
 
 		 143 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  63.57 
 
 		 141 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  61.48 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  60 
 
 		 171 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  60 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  64.75 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  60.16 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  43.66 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  32.82 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  33.87 
 
 		 226 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.79 
 
 		 862 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  34.59 
 
 		 436 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  27.54 
 
 		 331 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 		 863 aa  61.6  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 		 863 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 370 aa  60.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  30.07 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 410 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  34.68 
 
 		 191 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30 
 
 		 897 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 241 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  29.17 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  24.81 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  31.17 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  26.02 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.1 
 
 		 863 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  29.45 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  32.26 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 427 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 		 246 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  24.82 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  30.53 
 
 		 385 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  33.6 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  28.46 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 385 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  30.47 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  28.26 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 873 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  30.47 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  30.53 
 
 		 879 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  26.06 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  24.48 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  31.58 
 
 		 433 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  26.06 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  27.61 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  30.53 
 
 		 879 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.82 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0171  signal transduction protein  30 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.900499  normal  0.567274 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.53 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  29.51 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  25.81 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  25.9 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  31.78 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  29.79 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  30.91 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  29.79 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  24.26 
 
 		 300 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  24.8 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  25.17 
 
 		 243 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  28.28 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.69 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  26.21 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  27.01 
 
 		 488 aa  53.9  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3120  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.93 
 
 		 489 aa  53.9  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.899033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  28.46 
 
 		 859 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  25.18 
 
 		 863 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.03 
 
 		 132 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2400  CBS domain containing protein  26.52 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190312  decreased coverage  0.0000946646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  29.51 
 
 		 875 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  27.87 
 
 		 883 aa  52.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 		 385 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.37 
 
 		 338 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  30.53 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 		 224 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.26 
 
 		 226 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  25.2 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  24.5 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  28.36 
 
 		 880 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  25.9 
 
 		 881 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>