More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4720 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  86.15 
 
 		 168 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  83.08 
 
 		 171 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  69.53 
 
 		 141 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  60.16 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  60.16 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  60.47 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  61.82 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  41.09 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  43.08 
 
 		 142 aa  100  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  28.69 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.61 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  65.5  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 863 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  27.45 
 
 		 161 aa  62  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.87 
 
 		 191 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  29.23 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  30.26 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  29.01 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.23 
 
 		 862 aa  58.9  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.15 
 
 		 897 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 		 410 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  28.48 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.89 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1401  signal-transduction protein  32.59 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.78 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.23 
 
 		 888 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  26.05 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3080  putative signal transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0313978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  29.41 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  33.08 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  28.37 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  30.48 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 873 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  26.81 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  30.08 
 
 		 888 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.82 
 
 		 224 aa  53.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.37 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  29.41 
 
 		 436 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  30.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  29.93 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  29.29 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  28.69 
 
 		 883 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  23.85 
 
 		 257 aa  52.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28.8 
 
 		 863 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  27.78 
 
 		 331 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  26.06 
 
 		 230 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  27.66 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  29.17 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.61 
 
 		 863 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.06 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  26.53 
 
 		 380 aa  52.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2001  putative signal transduction protein with CBS domains  30.25 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0953206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.27 
 
 		 873 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5203  CBS domain containing protein  28.33 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  27.46 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  29.13 
 
 		 291 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  27.27 
 
 		 226 aa  51.6  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5476  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  32.58 
 
 		 201 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  27.66 
 
 		 348 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5097  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.67 
 
 		 580 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5185  signal-transduction protein  28.57 
 
 		 189 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  28.46 
 
 		 268 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  28.45 
 
 		 226 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  28.17 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  29.32 
 
 		 260 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 391 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3278  putative CBS domain-containing signal transduction protein  28 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565248  normal  0.216437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 		 391 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 		 279 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5005  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  22.83 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  27.64 
 
 		 269 aa  50.8  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  27.01 
 
 		 228 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  23.77 
 
 		 148 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  29.9 
 
 		 251 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  27.5 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  28.99 
 
 		 346 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  28.79 
 
 		 388 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  28.99 
 
 		 382 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  29.03 
 
 		 859 aa  50.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 152 aa  50.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  28.99 
 
 		 382 aa  50.1  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  28 
 
 		 366 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  29.25 
 
 		 280 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>