239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0749 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2669  putative transcriptional regulator, XRE family  48.45 
 
 
258 aa  259  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168086  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2228  signal-transduction protein  51.55 
 
 
258 aa  258  8e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1798  signal-transduction protein  51.37 
 
 
260 aa  258  9e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.961351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2904  signal-transduction protein  42.47 
 
 
259 aa  223  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  31.13 
 
 
258 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  28.12 
 
 
258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  29.02 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0967  hypothetical protein  24.03 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  30.49 
 
 
279 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  30.49 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.34 
 
 
423 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.9 
 
 
1665 aa  62.4  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.03 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  26.46 
 
 
427 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  25.85 
 
 
279 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  24.77 
 
 
171 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  34.15 
 
 
142 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0964  hypothetical protein  32.69 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 
859 aa  57.4  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  31.58 
 
 
845 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  33.93 
 
 
149 aa  57  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  25.44 
 
 
386 aa  56.6  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  27.92 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  30.4 
 
 
133 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0393  CBS domain-containing membrane protein  29.66 
 
 
193 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  28.68 
 
 
153 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
863 aa  55.8  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  34.38 
 
 
149 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  24.77 
 
 
168 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.83 
 
 
208 aa  55.5  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 
149 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.31 
 
 
143 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 
120 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1895  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 
133 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.272783 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  24.04 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0338  signal-transduction protein  32.17 
 
 
145 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  26.67 
 
 
153 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  23.85 
 
 
130 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  24.79 
 
 
209 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  27.67 
 
 
291 aa  52.4  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  23.94 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  29.63 
 
 
863 aa  52.4  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  27.14 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2666  putative signal transduction protein with CBS domains  24.84 
 
 
252 aa  52  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113422  normal  0.552797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 
133 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  25.91 
 
 
428 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1799  putative signal transduction protein with CBS domains  30.48 
 
 
202 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446245  normal  0.0519326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26.58 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0469  CBS domain containing protein  25.4 
 
 
138 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  27.35 
 
 
214 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  32.73 
 
 
141 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1885  signal-transduction protein  28.45 
 
 
145 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1488  signal-transduction protein  31.03 
 
 
142 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.661715 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0532  signal-transduction protein  25.95 
 
 
375 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0376075 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  26.67 
 
 
153 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1441  Polynucleotide adenylyltransferase region  27.34 
 
 
821 aa  50.1  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000556215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  25.79 
 
 
249 aa  50.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  23.08 
 
 
394 aa  49.7  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  30.63 
 
 
128 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  30.21 
 
 
149 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  27.21 
 
 
153 aa  49.7  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  30.43 
 
 
146 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  28.45 
 
 
160 aa  49.7  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  29.63 
 
 
165 aa  49.7  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  29.38 
 
 
413 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  35.29 
 
 
873 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  32.41 
 
 
883 aa  49.3  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  25.93 
 
 
229 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  34.29 
 
 
885 aa  49.3  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  26.02 
 
 
250 aa  49.3  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  29.81 
 
 
185 aa  49.3  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  29.09 
 
 
279 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  30.09 
 
 
141 aa  48.9  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  27.37 
 
 
143 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  25.53 
 
 
246 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2966  signal-transduction protein  31.82 
 
 
132 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  28.45 
 
 
145 aa  48.9  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
184 aa  48.5  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0164  signal transduction protein  20.44 
 
 
274 aa  48.9  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000193736 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1013  CBS domain containing membrane protein  23.37 
 
 
380 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  23.48 
 
 
384 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  28.7 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  29.63 
 
 
142 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  30.08 
 
 
142 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  26.04 
 
 
141 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  22.18 
 
 
282 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0705  putative signal transduction protein with CBS domains  28.95 
 
 
124 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.108789  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  34.74 
 
 
187 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  31.91 
 
 
875 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  24.14 
 
 
769 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  27.93 
 
 
132 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30 
 
 
153 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  28.45 
 
 
145 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  28.81 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  27.62 
 
 
148 aa  47.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  27.41 
 
 
258 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>