More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0838 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0838  signal transduction protein  100 
 
 		 279 aa  562  1.0000000000000001e-159  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.545659  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  54.35 
 
 		 277 aa  316  3e-85  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.66 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  30.57 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  34.44 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  32.52 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  27.95 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  28.03 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  27.65 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  28.69 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  33.58 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  36.22 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  35.38 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1505  CBS domain-containing protein  27.1 
 
 		 282 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.206773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  26.32 
 
 		 426 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  26.55 
 
 		 280 aa  75.5  0.0000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  27.75 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  32.04 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0750  hypothetical protein  31.46 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.341574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0630  CBS domain-containing protein  25 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  29.89 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  28.27 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  26.67 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0965  hypothetical protein  25.99 
 
 		 271 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  30.51 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1796  CBS domain-containing protein  30.29 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.507937  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  26.01 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  35.66 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0258  signal transduction protein  31.35 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100598  normal  0.0168412 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  28.02 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  30.63 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  40.54 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  31.89 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  26.77 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  38.89 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0345  signal-transduction protein  32.81 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  32.28 
 
 		 300 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1643  signal transduction protein  32.26 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1481  signal transduction protein  23.3 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0578  signal transduction protein  32.26 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  28.47 
 
 		 427 aa  66.2  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.99 
 
 		 907 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  33.08 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  30.71 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  29.92 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  26.48 
 
 		 688 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  34.62 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.63 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  28.78 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  28.16 
 
 		 381 aa  62.4  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  35.65 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  34.21 
 
 		 131 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  32.87 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  29.85 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  35.78 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  30.83 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.28 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  31.91 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  34.85 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.15 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2080  signal-transduction protein  35.38 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  25.91 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  25.62 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  38.1 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  38.1 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  38.1 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  33.07 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  29.81 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  26.79 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  32.73 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  28.8 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  32.03 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  34.23 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  33.08 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  35.43 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  30.43 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  29.93 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  28.12 
 
 		 286 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  34.07 
 
 		 769 aa  58.9  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  31.93 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  35.09 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  25.71 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  32.48 
 
 		 154 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  25.14 
 
 		 282 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2164  CBS domain containing protein  33.62 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0488  hypothetical protein  28.4 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.59 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  31.71 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0417  signal transduction protein  32.77 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.694858  normal  0.0742839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  29.32 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.06 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  29.23 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>