More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1031 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  292  9e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  79.72 
 
 		 146 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  61.7 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  58.82 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  57.45 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  56.74 
 
 		 171 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  60.47 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  57.94 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  46.48 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  44.37 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  31.97 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  34.35 
 
 		 897 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  34.97 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  28.78 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.5 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  36.29 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.97 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0966  hypothetical protein  29.85 
 
 		 331 aa  63.9  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2064  hypothetical protein  30.08 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.769911  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2773  putative signal transduction protein with CBS domains  32.26 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.08 
 
 		 862 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  32.8 
 
 		 251 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 		 370 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 256 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  28.37 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  29.2 
 
 		 320 aa  61.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  27.08 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  26.24 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  26.35 
 
 		 410 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  31.45 
 
 		 226 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.03 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 		 863 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  30.32 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.22 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  30.5 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 863 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 		 875 aa  57.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  29.08 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  32.28 
 
 		 634 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  25.87 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  29.69 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  31.21 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  25 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  28.67 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0550  CBS domain-containing protein  31.3 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3769  CBS domain-containing protein  30.65 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.48 
 
 		 863 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.42 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  28.03 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  26.8 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  31.62 
 
 		 436 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  27.82 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3439  hypothetical protein  29.77 
 
 		 385 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  25.52 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  27.34 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  26.81 
 
 		 863 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.37 
 
 		 620 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.892029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.08 
 
 		 427 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3678  CBS domain containing membrane protein  29.71 
 
 		 377 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0501093  normal  0.0630387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40540  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 		 385 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  29.08 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  28.39 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.71 
 
 		 223 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  26.09 
 
 		 229 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  26.09 
 
 		 229 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  27.66 
 
 		 338 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  28.15 
 
 		 219 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  27.14 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  21.54 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0628  signal transduction protein  36.25 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  25.52 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  29.86 
 
 		 879 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  29.37 
 
 		 423 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  29.86 
 
 		 879 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  29.63 
 
 		 880 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 242 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  28.57 
 
 		 332 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  25.58 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0942  CBS domain containing membrane protein  25 
 
 		 277 aa  51.6  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0100206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11190  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  28.79 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.170576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  33.82 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  33.82 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 260 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  26.15 
 
 		 225 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  33.82 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>