More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0098 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0098  CBS domain-containing protein  100 
 
 
150 aa  293  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0098  CBS domain-containing protein  99.33 
 
 
150 aa  291  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  57.64 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0970  CBS domain-containing protein  48.94 
 
 
155 aa  153  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0181  signal transduction protein  44.3 
 
 
152 aa  131  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0825  putative signal transduction protein with CBS domains  37.14 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  32.87 
 
 
423 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  32.19 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
152 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  34.42 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.14 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  32.54 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1310  CBS  36.91 
 
 
213 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  34.62 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 
228 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  30.99 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  34.03 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  29.25 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.34 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
427 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  31.94 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  31.13 
 
 
234 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  30.14 
 
 
246 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 
226 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  32.65 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  31.61 
 
 
428 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  30.14 
 
 
230 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2623  CBS domain containing membrane protein  29.1 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  30.72 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  32.76 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  30.61 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  28.19 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  28.19 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  32.89 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  28.57 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  28.48 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  28.97 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2287  CBS domain containing membrane protein  33.57 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.146345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  31.03 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  36.13 
 
 
426 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  28.78 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  26.85 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 
321 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1475  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.69 
 
 
321 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  30.99 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  29.05 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  31.21 
 
 
427 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  32.24 
 
 
241 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  31.51 
 
 
243 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 
227 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  31.47 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  30.56 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  32.24 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  27.08 
 
 
151 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  31.58 
 
 
339 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  32.39 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1021  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 
159 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473362  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1395  signal transduction protein  31.69 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1281  signal transduction protein  32.39 
 
 
153 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.366949  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  30.92 
 
 
230 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2434  CBS domain containing membrane protein  27.21 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0700724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  30.77 
 
 
223 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  30.86 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  28.97 
 
 
242 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  28.28 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  25.53 
 
 
488 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1108  CBS domain containing membrane protein  31.72 
 
 
221 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  27.89 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  32 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  28.57 
 
 
688 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  27.21 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  31.29 
 
 
232 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  27.59 
 
 
242 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
196 aa  58.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  35.17 
 
 
436 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  30.06 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  29.32 
 
 
683 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 
688 aa  57.8  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3446  signal transduction protein  28.67 
 
 
226 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  27.52 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
688 aa  57  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  32.82 
 
 
380 aa  57  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0394  CBS domain-containing membrane protein  31.11 
 
 
201 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.9 
 
 
243 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  28.19 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  31.29 
 
 
217 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  27.27 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  28.57 
 
 
226 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0112  signal transduction protein  26.9 
 
 
213 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0311515  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.75 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5608  signal transduction protein  30.34 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606425  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 
256 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
262 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  29.37 
 
 
224 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.8 
 
 
229 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  29.8 
 
 
226 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>