More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1039 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
260 aa  522  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  74.81 
 
 
268 aa  387  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  73.93 
 
 
268 aa  383  1e-105  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2164  CBS domain containing protein  66.07 
 
 
288 aa  353  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2843  CBS domain containing protein  68.38 
 
 
267 aa  330  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  50.97 
 
 
262 aa  255  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2618  CBS  51.17 
 
 
275 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  49.22 
 
 
261 aa  248  6e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1898  CBS domain-containing protein  48.44 
 
 
270 aa  245  6e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527597  normal  0.365874 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1386  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 
264 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  43.48 
 
 
512 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1290  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 
264 aa  204  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.382555 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0666  CBS domain-containing protein  42.56 
 
 
264 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1299  CBS domain-containing protein  40.39 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  38.14 
 
 
769 aa  74.3  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  41.53 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  32.81 
 
 
141 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  35.04 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 
863 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.19 
 
 
147 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 
873 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  28.39 
 
 
883 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 
859 aa  63.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.77 
 
 
141 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  27.18 
 
 
863 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 
225 aa  62.4  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.17 
 
 
877 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0601  signal transduction protein  37.5 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.35039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  32.48 
 
 
148 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  33.9 
 
 
165 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  33.98 
 
 
437 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  33.98 
 
 
437 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 
141 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  36.28 
 
 
373 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.28 
 
 
873 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 
141 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.89 
 
 
215 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  33.01 
 
 
437 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  33.01 
 
 
437 aa  58.9  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  33.01 
 
 
437 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  33.01 
 
 
437 aa  58.9  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  34.78 
 
 
377 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  33.01 
 
 
437 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  32.74 
 
 
880 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  32.17 
 
 
145 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  34.48 
 
 
139 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1899  putative signal transduction protein with CBS domains  32 
 
 
149 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  29.8 
 
 
865 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.48 
 
 
488 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4440  signal-transduction protein  34.02 
 
 
437 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  33.6 
 
 
500 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  31.36 
 
 
907 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  34.17 
 
 
394 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1708  phosphoesterase, RecJ-like  36.67 
 
 
904 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.833662  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  30.08 
 
 
875 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.3 
 
 
897 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0529  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  33.64 
 
 
487 aa  57.4  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  34.82 
 
 
435 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  32.04 
 
 
437 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 
232 aa  56.6  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.48 
 
 
461 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  33.63 
 
 
885 aa  56.2  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1821  CBS domain containing protein  32.56 
 
 
157 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  34.44 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  35.71 
 
 
437 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4720  thioesterase family protein  32.04 
 
 
437 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 
432 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 
153 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  32.17 
 
 
282 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4414  CBS domain-containing protein  35.2 
 
 
146 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.718009 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  31.54 
 
 
867 aa  55.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  28.46 
 
 
890 aa  54.7  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
606 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4294  polynucleotide adenylyltransferase region  32.77 
 
 
907 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00498072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  31.75 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65804  predicted protein  34.26 
 
 
524 aa  55.1  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0114007  normal  0.2488 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  32.61 
 
 
434 aa  55.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  37.06 
 
 
393 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  33.62 
 
 
879 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  33.9 
 
 
380 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  34.17 
 
 
606 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  33.62 
 
 
879 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  28.12 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  31.01 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.73 
 
 
580 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  29.17 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1423  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  31.82 
 
 
487 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  34.17 
 
 
606 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  32.95 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  30 
 
 
155 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0699  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
625 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0116377  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2632  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.45 
 
 
486 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2185  signal transduction protein  35.59 
 
 
170 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 
144 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  35.71 
 
 
438 aa  53.1  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>