More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2169 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  100 
 
 
261 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  81.54 
 
 
262 aa  435  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1898  CBS domain-containing protein  78.46 
 
 
270 aa  422  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527597  normal  0.365874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2618  CBS  68.09 
 
 
275 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  54.51 
 
 
512 aa  286  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3243  CBS domain containing protein  53.91 
 
 
268 aa  272  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1105  putative signal transduction protein with CBS domains  51.95 
 
 
268 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  49.22 
 
 
260 aa  248  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2843  CBS domain containing protein  48.81 
 
 
267 aa  241  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0285947  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2164  CBS domain containing protein  44.6 
 
 
288 aa  233  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.866866 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1299  CBS domain-containing protein  45.68 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1290  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 
264 aa  208  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.382555 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0666  CBS domain-containing protein  43.21 
 
 
264 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1386  CBS domain-containing protein  42.15 
 
 
264 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  40.96 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  42.73 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  36.36 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.77 
 
 
148 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  34.17 
 
 
147 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  36.75 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  32.23 
 
 
859 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  31.34 
 
 
859 aa  71.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  32 
 
 
269 aa  71.6  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.6 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  37.84 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  37.04 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  36.04 
 
 
284 aa  68.9  0.00000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.48 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  39.08 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.89 
 
 
144 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  39.08 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  39.13 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  31.94 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  39.08 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  39.08 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  39.08 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  39.08 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  39.08 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  33.9 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  36.13 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  32.82 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1234  CBS domain containing membrane protein  37.07 
 
 
380 aa  67  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4440  signal-transduction protein  36.08 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0015  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.15 
 
 
489 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  34.4 
 
 
141 aa  67  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.43 
 
 
482 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  36.11 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.19 
 
 
495 aa  66.6  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  32.52 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.08 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  37.93 
 
 
437 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  31.71 
 
 
859 aa  66.2  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1203  signal transduction protein  31.67 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.803351  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  28 
 
 
875 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2219  CBS domain containing protein  28.7 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.338208  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  33.62 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  39.32 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  32.81 
 
 
883 aa  65.5  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  30.2 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4720  thioesterase family protein  36.78 
 
 
437 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  35.23 
 
 
437 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.69 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  30.08 
 
 
862 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.46 
 
 
845 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  32.56 
 
 
149 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.71 
 
 
504 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  32.48 
 
 
863 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
865 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 
143 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1795  CBS domain-containing protein  31.45 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.346551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  31.54 
 
 
769 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  36.11 
 
 
500 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  42.7 
 
 
508 aa  63.2  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1395  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 
137 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  32.48 
 
 
141 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  33.05 
 
 
166 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  32.06 
 
 
208 aa  62.4  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  35.4 
 
 
377 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.04 
 
 
142 aa  62  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  34.4 
 
 
208 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.49 
 
 
161 aa  62  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  29.31 
 
 
460 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  32.76 
 
 
141 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.75 
 
 
873 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26.56 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004008  inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  31.75 
 
 
139 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  31.03 
 
 
513 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  34.21 
 
 
504 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  31.03 
 
 
513 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  35.87 
 
 
438 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  33.06 
 
 
137 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1719  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
143 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658293 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  32.48 
 
 
165 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  32.26 
 
 
435 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3126  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  35.59 
 
 
486 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.151477 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0928  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.52 
 
 
612 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.453543  hitchhiker  0.000208416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>