More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1370 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1370  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 171 aa  358  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1350  CBS domain containing membrane protein  85.88 
 
 		 168 aa  293  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4720  CBS domain containing membrane protein  83.08 
 
 		 130 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236602  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4046  CBS domain-containing protein  71.43 
 
 		 141 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2791  hypothetical protein  60.71 
 
 		 141 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402578  normal  0.193338 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1918  CBS domain-containing protein  60 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.406809  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4373  CBS domain-containing protein  63.93 
 
 		 154 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1031  hypothetical protein  56.74 
 
 		 143 aa  160  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2016  CBS domain-containing protein  42.55 
 
 		 144 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2074  signal transduction protein  41.55 
 
 		 142 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.350465  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 		 863 aa  70.1  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.6 
 
 		 863 aa  68.6  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  31.15 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  33.33 
 
 		 863 aa  65.1  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3318  protein of unknown function DUF190  31.33 
 
 		 436 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3392  protein of unknown function DUF190  30.67 
 
 		 433 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2230  signal transduction protein  28.03 
 
 		 249 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  29.73 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  31.47 
 
 		 879 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1761  CBS domain-containing protein  24.24 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000282472  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2680  Chloride channel core  31.47 
 
 		 879 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  30.33 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0239  signal transduction protein  31.3 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.371768 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  28.38 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25.48 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  32.52 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  31.08 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  29.92 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  29.55 
 
 		 859 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.48 
 
 		 863 aa  59.7  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0847  signal transduction protein  30 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.766257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.13 
 
 		 873 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 391 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  31.21 
 
 		 897 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0486  signal transduction protein  29.77 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0706  CBS domain containing protein  33.61 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  30.88 
 
 		 378 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  30.82 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  29.03 
 
 		 883 aa  58.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0749  hypothetical protein  24.77 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.388529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  28.86 
 
 		 427 aa  57.4  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  26.52 
 
 		 862 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1297  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  29.6 
 
 		 888 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.795106  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  28.97 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  27.4 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  28.57 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  28.29 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  27.45 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.91 
 
 		 769 aa  55.1  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  29.41 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1197  signal-transduction protein  31.13 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.749795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0968  hypothetical protein  32.04 
 
 		 258 aa  54.7  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  38.71 
 
 		 428 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  31.25 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0679  polynucleotide adenylyltransferase region  32.03 
 
 		 888 aa  54.7  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.197003  normal  0.0338911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  27.78 
 
 		 382 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1105  CBS domain containing membrane protein  27.46 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  29.23 
 
 		 859 aa  54.3  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  26.61 
 
 		 859 aa  54.3  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  29.66 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  30.53 
 
 		 282 aa  54.3  0.0000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1039  putative signal transduction protein with CBS domains  28.12 
 
 		 260 aa  53.9  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  27.01 
 
 		 224 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36650  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000287918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.83 
 
 		 580 aa  54.3  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3147  hypothetical protein  30.83 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.643619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  26.32 
 
 		 880 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  28.35 
 
 		 366 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  27.94 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0301  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 262 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  25.38 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  26.71 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.72 
 
 		 279 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 366 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  25.19 
 
 		 279 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  26.77 
 
 		 269 aa  53.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  27.78 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  31.39 
 
 		 223 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  29.79 
 
 		 388 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  29.46 
 
 		 246 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  27.63 
 
 		 241 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  28 
 
 		 875 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  25.76 
 
 		 374 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  30.7 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  24.39 
 
 		 139 aa  52  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  26.19 
 
 		 875 aa  52  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  23.81 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  28.36 
 
 		 603 aa  52  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3306  polynucleotide adenylyltransferase region  25 
 
 		 881 aa  52  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0102582  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0058  CBS domain containing membrane protein  25.78 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 		 280 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  29.08 
 
 		 381 aa  51.6  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  29.05 
 
 		 431 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>