More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2094 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  74.53 
 
 		 605 aa  811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  68.77 
 
 		 604 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  100 
 
 		 603 aa  1172    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  68.85 
 
 		 603 aa  772    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5812  chloride channel core  80 
 
 		 634 aa  788    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00468888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  65.13 
 
 		 600 aa  709    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3157  CBS domain-containing protein  56.99 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.687522  normal  0.772709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2674  CBS:Cl- channel, voltage gated  52.92 
 
 		 584 aa  497  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2699  Chloride channel core  54.85 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4484  chloride channel core  51.76 
 
 		 605 aa  490  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6375  Chloride channel core  52.6 
 
 		 595 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0584  Cl- channel, voltage gated  52.84 
 
 		 637 aa  486  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2309  Chloride channel core  54.5 
 
 		 605 aa  487  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.76278  hitchhiker  0.00000714896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4117  chloride channel core  52.78 
 
 		 595 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3462  CBS domain-containing protein  53.25 
 
 		 634 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3967  Cl- channel, voltage-gated family protein  51.2 
 
 		 595 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995893  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4429  chloride channel core  51.2 
 
 		 595 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1401  chloride channel (ClC) family protein  51.84 
 
 		 623 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1486  chloride channel (ClC) family protein  51.76 
 
 		 623 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.877185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3070  chloride channel core  55.67 
 
 		 590 aa  475  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal  0.0360231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5761  chloride channel core  51.19 
 
 		 595 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1199  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  51.76 
 
 		 634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.383794  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1302  Cl- channel, voltage gated  50.26 
 
 		 595 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719917  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1138  chloride channel (ClC) family protein  51.76 
 
 		 634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3825  Cl- channel, voltage gated  51.19 
 
 		 595 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722895  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0315  CBS domain-containing protein  53.23 
 
 		 609 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4543  Cl- channel, voltage-gated family protein  51.19 
 
 		 595 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763229  normal  0.0966247 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0161  chloride channel (ClC) family protein  51.76 
 
 		 634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740673  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0439  chloride channel (ClC) family protein  51.76 
 
 		 634 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.662875  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0005  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  53.42 
 
 		 590 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0837  Chloride channel core  52.65 
 
 		 596 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1084  Chloride channel core  45.54 
 
 		 606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1397  voltage-gated chloride channel/CBS domain-containing protein  52.64 
 
 		 618 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2431  hypothetical protein  54.2 
 
 		 599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  50.59 
 
 		 633 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3930  voltage-gated chloride channel  52.18 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000147499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2950  Cl- channel, voltage gated  39.77 
 
 		 613 aa  395  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.952562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  32.5 
 
 		 577 aa  252  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1823  putative chloride channel  33.53 
 
 		 593 aa  217  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.039576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2221  putative chloride channel  33.59 
 
 		 590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247066  decreased coverage  0.00811968 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3482  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.87 
 
 		 582 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  30.96 
 
 		 629 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2794  chloride channel protein EriC  29.4 
 
 		 608 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000831422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1639  Cl- channel voltage-gated family protein  31.82 
 
 		 597 aa  190  7e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2363  chloride channel family protein, putative  30.06 
 
 		 614 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.325858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6434  Chloride channel core  32.48 
 
 		 600 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.741309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  31.4 
 
 		 615 aa  180  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1400  chloride channel, putative  28.88 
 
 		 631 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  32.78 
 
 		 669 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3470  Cl- channel, voltage gated  28.95 
 
 		 613 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1107  Chloride channel core  33.51 
 
 		 470 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1246  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.06 
 
 		 620 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.9 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1465  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.68 
 
 		 580 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  32.86 
 
 		 626 aa  173  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3504  chloride channel family protein  28.75 
 
 		 602 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.88 
 
 		 587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  28.01 
 
 		 569 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0493  Chloride channel core  25 
 
 		 598 aa  166  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3819  Cl- channel voltage-gated family protein  35.76 
 
 		 456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1514  Chloride channel core  29.77 
 
 		 627 aa  162  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1622  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.07 
 
 		 754 aa  161  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2352  Cl- channel, voltage-gated family protein  31 
 
 		 612 aa  161  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1130  Chloride channel core  27.02 
 
 		 617 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.711755  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11720  Chloride channel core  32.28 
 
 		 402 aa  160  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000807988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1620  chloride channel protein EriC  28.95 
 
 		 606 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1448  Chloride channel core  28.43 
 
 		 627 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.132053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5033  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.47 
 
 		 598 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.65 
 
 		 584 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0919  chloride channel, putative  29.11 
 
 		 624 aa  156  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.870319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2293  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.88 
 
 		 636 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2160  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.08 
 
 		 579 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0956  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.08 
 
 		 579 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2101  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.08 
 
 		 579 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.516415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2291  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.75 
 
 		 628 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.369864  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1750  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.42 
 
 		 589 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6342  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.06 
 
 		 589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.867968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.47 
 
 		 593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1737  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.06 
 
 		 589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1658  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.47 
 
 		 593 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1975  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.23 
 
 		 591 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224056  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2283  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.67 
 
 		 591 aa  143  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  28.06 
 
 		 862 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  28.66 
 
 		 875 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1761  Chloride channel core  29.01 
 
 		 605 aa  140  7e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1184  Chloride channel core  29.11 
 
 		 628 aa  140  8.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0945746  normal  0.895336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3801  Chloride channel core  30.39 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101597 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3914  Chloride channel core  30.39 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1258  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  26.01 
 
 		 577 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.725584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4402  Cl- channel, voltage-gated family protein  26.17 
 
 		 598 aa  137  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0824696  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01992  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  30.23 
 
 		 461 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2453  Cl- channel voltage-gated family protein  26.97 
 
 		 605 aa  136  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4507  Cl- channel, voltage-gated family protein  25.71 
 
 		 594 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0525  Cl- channel voltage-gated family protein  26.28 
 
 		 579 aa  136  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.94 
 
 		 863 aa  136  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1522  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  28.46 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.457794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  29.69 
 
 		 897 aa  134  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.47 
 
 		 575 aa  133  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2495  Cl- channel voltage-gated family protein  28.73 
 
 		 651 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.575116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0176  chloride channel core  28.54 
 
 		 586 aa  132  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.406579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>